RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
FOXD1-201ENST00000513595 STRCQ7RTU9 1775 aa21.61■■□□□ 1.05
FOXD1-201ENST00000513595 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.6■■□□□ 1.05
FOXD1-201ENST00000513595 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.6■■□□□ 1.05
FOXD1-201ENST00000513595 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.56■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 AKNAQ7Z591 1439 aa21.56■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.56■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.55■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.55■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.53■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 PTPRTO14522 1441 aa21.52■■□□□ 1.04
FOXD1-201ENST00000513595 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.5■■□□□ 1.03
FOXD1-201ENST00000513595 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXD1-201ENST00000513595 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.49■■□□□ 1.03
FOXD1-201ENST00000513595 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
FOXD1-201ENST00000513595 RICTORQ6R327 1708 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXD1-201ENST00000513595 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.45■■□□□ 1.03
FOXD1-201ENST00000513595 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 KCNA4P22459 653 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 P3H3Q8IVL6 736 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 PRXQ9BXM0 1461 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.39■■□□□ 1.02
FOXD1-201ENST00000513595 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
FOXD1-201ENST00000513595 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.36■■□□□ 1.01
FOXD1-201ENST00000513595 HSPA1LP34931 641 aa21.34■■□□□ 1.01
FOXD1-201ENST00000513595 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.34■■□□□ 1.01
FOXD1-201ENST00000513595 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.33■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 ATP10AO60312 1499 aa21.32■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 HECW1Q76N89 1606 aa21.32■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.29■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 NCOA1Q15788 1441 aa21.28■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.28■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 PIP4K2BP78356 416 aa21.27■■□□□ 1
FOXD1-201ENST00000513595 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
FOXD1-201ENST00000513595 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.26■□□□□ 0.99
FOXD1-201ENST00000513595 SAMD9Q5K651 1589 aa21.22■□□□□ 0.99
FOXD1-201ENST00000513595 PLCH2O75038 1416 aa21.2■□□□□ 0.98
FOXD1-201ENST00000513595 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.18■□□□□ 0.98
FOXD1-201ENST00000513595 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.17■□□□□ 0.98
FOXD1-201ENST00000513595 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.16■□□□□ 0.98
FOXD1-201ENST00000513595 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
FOXD1-201ENST00000513595 C3P01024 1663 aa21.15■□□□□ 0.98
FOXD1-201ENST00000513595 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.14■□□□□ 0.97
FOXD1-201ENST00000513595 CEP162Q5TB80 1403 aa21.12■□□□□ 0.97
FOXD1-201ENST00000513595 TOM1O60784 492 aa21.11■□□□□ 0.97
FOXD1-201ENST00000513595 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
FOXD1-201ENST00000513595 AFAP1Q8N556 730 aa21.09■□□□□ 0.97
FOXD1-201ENST00000513595 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.09■□□□□ 0.97
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.07■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 REREQ9P2R6 1566 aa21.05■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 CLIP1P30622 1438 aa21.04■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 PKD2Q13563 968 aa21.03■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.03■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 AGLP35573 1532 aa21.02■□□□□ 0.96
FOXD1-201ENST00000513595 KDM5CP41229 1560 aa21.02■□□□□ 0.95
FOXD1-201ENST00000513595 NPATQ14207 1427 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXD1-201ENST00000513595 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.01■□□□□ 0.95
FOXD1-201ENST00000513595 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
FOXD1-201ENST00000513595 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.98■□□□□ 0.95
FOXD1-201ENST00000513595 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
FOXD1-201ENST00000513595 PLA2R1Q13018 1463 aa20.95■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 SLC4A2P04920 1241 aa20.94■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 ZMYM3Q14202 1370 aa20.93■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 CPS1P31327 1500 aa20.91■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 ABCA6Q8N139 1617 aa20.91■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.91■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 PTPRKQ15262 1439 aa20.9■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.89■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.89■□□□□ 0.94
FOXD1-201ENST00000513595 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.86■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 POTEAQ6S8J7 498 aa20.85■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.85■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 MROH2AA6NES4 1674 aa20.83■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.83■□□□□ 0.93
FOXD1-201ENST00000513595 ALKQ9UM73 1620 aa20.82■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 KIF14Q15058 1648 aa20.81■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa20.77■□□□□ 0.92
FOXD1-201ENST00000513595 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms