RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.68	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	NCAPD3	P42695	1498 aa		10.67	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.66	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGXB3	Q12766	1538 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	SPOCK2	Q92563	424 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FBXO38-208	ENST00000504971	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71	8e-7	■■■■■ 32.4
FBXO38-208	ENST00000504971	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FBXO38-208	ENST00000504971	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FBXO38-208	ENST00000504971	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FBXO38-208	ENST00000504971	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FBXO38-208	ENST00000504971	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.57	□□□□□ -0.72
FBXO38-208	ENST00000504971	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
FBXO38-208	ENST00000504971	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
FBXO38-208	ENST00000504971	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		10.55	□□□□□ -0.72
FBXO38-208	ENST00000504971	CABP2	Q9NPB3	220 aa		10.55	□□□□□ -0.72
FBXO38-208	ENST00000504971	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		10.55	□□□□□ -0.72
FBXO38-208	ENST00000504971	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.52	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.51	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	MMRN1	Q13201	1228 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM41	Q8WV44	630 aa		10.5	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	EMP3	P54852	163 aa		10.48	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
FBXO38-208	ENST00000504971	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		10.45	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.44	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		10.44	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971		G3V3G9	751 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		10.42	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.4	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971	CFTR	P13569	1480 aa		10.4	□□□□□ -0.74
FBXO38-208	ENST00000504971	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.38	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	BCL11A	Q9H165	835 aa		10.38	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDM2	Q13029	1718 aa		10.36	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX12	O15370	315 aa		10.35	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.35	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		10.35	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.34	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	MICALL2	Q8IY33	904 aa		10.34	□□□□□ -0.75
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		10.33	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.33	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		10.32	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	10.32	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	ABCC8	Q09428	1581 aa		10.31	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.31	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		10.3	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.28	□□□□□ -0.76
FBXO38-208	ENST00000504971	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		10.27	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.26	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	ERBB3	P21860	1342 aa		10.25	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	SYNJ1	O43426	1573 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	EEA1	Q15075	1411 aa		10.24	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.23	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		10.22	□□□□□ -0.77
FBXO38-208	ENST00000504971	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		10.21	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	CUX1	P39880	1505 aa		10.2	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		10.19	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	NLRP6	P59044	892 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	NES	P48681	1621 aa		10.18	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.17	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		10.16	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	MFRP	Q9BY79	579 aa		10.15	□□□□□ -0.78
FBXO38-208	ENST00000504971	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	SOGA1	O94964	1423 aa		10.13	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF3C	O14782	793 aa		10.12	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	TOPBP1	Q92547	1522 aa		10.11	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.1	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	NEFL	P07196	543 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		10.09	□□□□□ -0.79
FBXO38-208	ENST00000504971	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		10.08	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		10.07	□□□□□ -0.8
FBXO38-208	ENST00000504971	KIF21B	O75037	1637 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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