RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 MYOM3Q5VTT5 1437 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 GRIN2BQ13224 1484 aa17.1■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 UACAQ9BZF9 1416 aa17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
RABGEF1-211ENST00000503687 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 FYCO1Q9BQS8 1478 aa17.05■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 PRDM2Q13029 1718 aa17.04■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.03■□□□□ 0.32
RABGEF1-211ENST00000503687 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF7Q2M1P5 1343 aa17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 NEUROD2Q15784 382 aa17■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRGP23470 1445 aa16.99■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.98■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 EFCAB5A4FU69 1503 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 NAIPQ13075 1403 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 IFT140Q96RY7 1462 aa16.97■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC7Q96M83 1385 aa16.96■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 HFM1A2PYH4 1435 aa16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.95■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 MAPKBP1O60336 1514 aa16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPRKQ15262 1439 aa16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 USP47Q96K76 1375 aa16.94■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 NUDCQ9Y266 331 aa16.92■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 CUL7Q14999 1698 aa16.9■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 RGS3P49796 1198 aa16.9■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 TMF1P82094 1093 aa16.89■□□□□ 0.3
RABGEF1-211ENST00000503687 PLIN1O60240 522 aa16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.88■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBED9Q6R2W3 1325 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PLB1Q6P1J6 1458 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 IQGAP2Q13576 1575 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.294e-7■■□□□ 12.5
RABGEF1-211ENST00000503687 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 PANK3Q9H999 370 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-211ENST00000503687 EXOC6Q8TAG9 804 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ARXQ96QS3 562 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 GGT6Q6P531 493 aa16.82■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 RALBP1Q15311 655 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 NLRP13Q86W25 1043 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 GRIN2AQ12879 1464 aa16.81■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.8■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 MAP3K1Q13233 1512 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF3BO15066 747 aa16.79■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC24A1O60721 1099 aa16.77■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 CDCA8Q53HL2 280 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 KIF15Q9NS87 1388 aa16.76■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 AKNAQ7Z591 1439 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 HECW1Q76N89 1606 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 AFAP1Q8N556 730 aa16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 NEFMP07197 916 aa16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 DAPK1P53355 1430 aa16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 SYNJ2O15056 1496 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.72■□□□□ 0.27
RABGEF1-211ENST00000503687 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PTPN23Q9H3S7 1636 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 MIA2Q96PC5 1412 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 MLECQ14165 292 aa16.7■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 STK26Q9P289 416 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ARHGEF11O15085 1522 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 ABCC5O15440 1437 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-211ENST00000503687 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms