RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495695.1

LAMA5-212, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 780 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-212ENST00000495695 HECW1Q76N89 1606 aa32.98■■■□□ 2.87
LAMA5-212ENST00000495695 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.95■■■□□ 2.87
LAMA5-212ENST00000495695 ATP10AO60312 1499 aa32.93■■■□□ 2.86
LAMA5-212ENST00000495695 HSPA2P54652 639 aa32.92■■■□□ 2.86
LAMA5-212ENST00000495695 MLECQ14165 292 aa32.92■■■□□ 2.86
LAMA5-212ENST00000495695 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.9■■■□□ 2.86
LAMA5-212ENST00000495695 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.87■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.87■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 MYO5CQ9NQX4 1742 aa32.85■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.84■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.83■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.83■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.83■■■□□ 2.85
LAMA5-212ENST00000495695 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.82■■■□□ 2.84
LAMA5-212ENST00000495695 CLIP1P30622 1438 aa32.81■■■□□ 2.84
LAMA5-212ENST00000495695 KIF14Q15058 1648 aa32.79■■■□□ 2.84
LAMA5-212ENST00000495695 CERKQ8TCT0 537 aa32.77■■■□□ 2.84
LAMA5-212ENST00000495695 AFAP1Q8N556 730 aa32.75■■■□□ 2.83
LAMA5-212ENST00000495695 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.75■■■□□ 2.83
LAMA5-212ENST00000495695 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.75■■■□□ 2.83
LAMA5-212ENST00000495695 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.73■■■□□ 2.83
LAMA5-212ENST00000495695 KDM5CP41229 1560 aa32.72■■■□□ 2.83
LAMA5-212ENST00000495695 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.71■■■□□ 2.83
LAMA5-212ENST00000495695 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.69■■■□□ 2.82
LAMA5-212ENST00000495695 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
LAMA5-212ENST00000495695 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.66■■■□□ 2.82
LAMA5-212ENST00000495695 REREQ9P2R6 1566 aa32.66■■■□□ 2.82
LAMA5-212ENST00000495695 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.63■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP32.61■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.61■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32.6■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.58■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.58■■■□□ 2.81
LAMA5-212ENST00000495695 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa32.57■■■□□ 2.8
LAMA5-212ENST00000495695 AGLP35573 1532 aa32.56■■■□□ 2.8
LAMA5-212ENST00000495695 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa32.54■■■□□ 2.8
LAMA5-212ENST00000495695 PREX2Q70Z35 1606 aa32.52■■■□□ 2.8
LAMA5-212ENST00000495695 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.51■■■□□ 2.8
LAMA5-212ENST00000495695 ABCC1P33527 1531 aa32.51■■■□□ 2.79
LAMA5-212ENST00000495695 ABCA6Q8N139 1617 aa32.49■■■□□ 2.79
LAMA5-212ENST00000495695 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.48■■■□□ 2.79
LAMA5-212ENST00000495695 STRCQ7RTU9 1775 aa32.47■■■□□ 2.79
LAMA5-212ENST00000495695 PTPRTO14522 1441 aa32.46■■■□□ 2.79
LAMA5-212ENST00000495695 C3P01024 1663 aa32.43■■■□□ 2.78
LAMA5-212ENST00000495695 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.43■■■□□ 2.78
LAMA5-212ENST00000495695 FYCO1Q9BQS8 1478 aa32.41■■■□□ 2.78
LAMA5-212ENST00000495695 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.39■■■□□ 2.78
LAMA5-212ENST00000495695 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.37■■■□□ 2.77
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
LAMA5-212ENST00000495695 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
LAMA5-212ENST00000495695 NPATQ14207 1427 aa32.34■■■□□ 2.77
LAMA5-212ENST00000495695 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.32■■■□□ 2.77
LAMA5-212ENST00000495695 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.31■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.29■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.28■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 ZMYM3Q14202 1370 aa32.28■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 NCOA1Q15788 1441 aa32.27■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 MROH2AA6NES4 1674 aa32.27■■■□□ 2.76
LAMA5-212ENST00000495695 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.25■■■□□ 2.75
LAMA5-212ENST00000495695 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.24■■■□□ 2.75
LAMA5-212ENST00000495695 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.22■■■□□ 2.75
LAMA5-212ENST00000495695 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.21■■■□□ 2.75
LAMA5-212ENST00000495695 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.19■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 LTBP4Q8N2S1 1624 aa32.19■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 ATP7AQ04656 1500 aa32.19■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 A2MP01023 1474 aa32.17■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa32.15■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 MTUS2Q5JR59 1369 aa32.15■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 PKD2Q13563 968 aa32.14■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 PLXNC1O60486 1568 aa32.14■■■□□ 2.74
LAMA5-212ENST00000495695 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
LAMA5-212ENST00000495695 GGT6Q6P531 493 aa32.11■■■□□ 2.73
LAMA5-212ENST00000495695 PLA2R1Q13018 1463 aa32.09■■■□□ 2.73
LAMA5-212ENST00000495695 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa32.08■■■□□ 2.73
LAMA5-212ENST00000495695 PTPRKQ15262 1439 aa32.08■■■□□ 2.73
LAMA5-212ENST00000495695 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
LAMA5-212ENST00000495695 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.04■■■□□ 2.72
LAMA5-212ENST00000495695 SOCS7O14512 581 aa32.04■■■□□ 2.72
LAMA5-212ENST00000495695 ILDR2Q71H61 639 aa32.03■■■□□ 2.72
LAMA5-212ENST00000495695 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.02■■■□□ 2.72
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
LAMA5-212ENST00000495695 MYO3AQ8NEV4 1616 aa32■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 MBD5Q9P267 1494 aa31.99■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.97■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.95■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 CEP162Q5TB80 1403 aa31.95■■■□□ 2.71
LAMA5-212ENST00000495695 TIAM1Q13009 1591 aa31.94■■■□□ 2.7
LAMA5-212ENST00000495695 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.93■■■□□ 2.7
LAMA5-212ENST00000495695 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.93■■■□□ 2.7
LAMA5-212ENST00000495695 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.91■■■□□ 2.7
LAMA5-212ENST00000495695 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.87■■■□□ 2.69
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