RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.16■■□□□ 1.94
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TSPAN4-212ENST00000494815 ROCK1Q13464 1354 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPAN4-212ENST00000494815 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.14■■□□□ 1.94
TSPAN4-212ENST00000494815 MAPKBP1O60336 1514 aa27.13■■□□□ 1.93
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TSPAN4-212ENST00000494815 TSPY10P0CW01 314 aa26.85■■□□□ 1.89
TSPAN4-212ENST00000494815 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.84■■□□□ 1.89
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TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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TSPAN4-212ENST00000494815 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.81■■□□□ 1.88
TSPAN4-212ENST00000494815 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN4-212ENST00000494815 ASXL2Q76L83 1435 aa26.78■■□□□ 1.88
TSPAN4-212ENST00000494815 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.77■■□□□ 1.88
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TSPAN4-212ENST00000494815 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.76■■□□□ 1.88
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TSPAN4-212ENST00000494815 KIF15Q9NS87 1388 aa26.72■■□□□ 1.87
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TSPAN4-212ENST00000494815 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.69■■□□□ 1.86
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TSPAN4-212ENST00000494815 TONSLQ96HA7 1378 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN4-212ENST00000494815 PLXNC1O60486 1568 aa26.66■■□□□ 1.86
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
TSPAN4-212ENST00000494815 FANCAO15360 1455 aa26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-212ENST00000494815 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.62■■□□□ 1.85
TSPAN4-212ENST00000494815 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.6■■□□□ 1.85
TSPAN4-212ENST00000494815 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
TSPAN4-212ENST00000494815 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.58■■□□□ 1.85
TSPAN4-212ENST00000494815 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.55■■□□□ 1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 NUP155O75694 1391 aa26.55■■□□□ 1.84
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TSPAN4-212ENST00000494815 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
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TSPAN4-212ENST00000494815 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.48■■□□□ 1.83
TSPAN4-212ENST00000494815 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.48■■□□□ 1.83
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TSPAN4-212ENST00000494815 AFAP1Q8N556 730 aa26.46■■□□□ 1.83
TSPAN4-212ENST00000494815 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
TSPAN4-212ENST00000494815 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.43■■□□□ 1.82
TSPAN4-212ENST00000494815 ATP7AQ04656 1500 aa26.41■■□□□ 1.82
TSPAN4-212ENST00000494815 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.41■■□□□ 1.82
TSPAN4-212ENST00000494815 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.39■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 MIER1Q8N108 512 aa26.38■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.37■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.36■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 NEO1Q92859 1461 aa26.35■■□□□ 1.81
TSPAN4-212ENST00000494815 GLI2P10070 1586 aa26.35■■□□□ 1.81
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