RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.17■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.16■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.14■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 ANP32CO43423 234 aa30.14■■■□□ 2.42
CERKL-213ENST00000494398 NUP160Q12769 1436 aa30.13■■■□□ 2.41
CERKL-213ENST00000494398 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CERKL-213ENST00000494398 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
CERKL-213ENST00000494398 FOXD1Q16676 465 aa30.09■■■□□ 2.41
CERKL-213ENST00000494398 CCER2I3L3R5 266 aa30.06■■■□□ 2.4
CERKL-213ENST00000494398 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.02■■■□□ 2.4
CERKL-213ENST00000494398 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
CERKL-213ENST00000494398 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CERKL-213ENST00000494398 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.01■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.99■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.98■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.96■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
CERKL-213ENST00000494398 KIF14Q15058 1648 aa29.95■■■□□ 2.38
CERKL-213ENST00000494398 NCOA1Q15788 1441 aa29.93■■■□□ 2.38
CERKL-213ENST00000494398 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.93■■■□□ 2.38
CERKL-213ENST00000494398 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CERKL-213ENST00000494398 ABCA8O94911 1581 aa29.88■■■□□ 2.37
CERKL-213ENST00000494398 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.88■■■□□ 2.37
CERKL-213ENST00000494398 ATP10BO94823 1461 aa29.87■■■□□ 2.37
CERKL-213ENST00000494398 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.85■■■□□ 2.37
CERKL-213ENST00000494398 ADGRL2O95490 1459 aa29.84■■■□□ 2.37
CERKL-213ENST00000494398 PZPP20742 1482 aa29.82■■■□□ 2.36
CERKL-213ENST00000494398 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.81■■■□□ 2.36
CERKL-213ENST00000494398 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.81■■■□□ 2.36
CERKL-213ENST00000494398 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.8■■■□□ 2.36
CERKL-213ENST00000494398 PTPRGP23470 1445 aa29.78■■■□□ 2.36
CERKL-213ENST00000494398 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.78■■■□□ 2.36
CERKL-213ENST00000494398 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.75■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.75■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.73■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 TSPY4P0CV99 314 aa29.73■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 TSPY10P0CW01 314 aa29.73■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 PKD2Q13563 968 aa29.73■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.72■■■□□ 2.35
CERKL-213ENST00000494398 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.7■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.68■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 CCDC7Q96M83 1385 aa29.68■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.67■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 NUP155O75694 1391 aa29.64■■■□□ 2.34
CERKL-213ENST00000494398 FKBP8Q14318 412 aa29.62■■■□□ 2.33
CERKL-213ENST00000494398 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.62■■■□□ 2.33
CERKL-213ENST00000494398 NEFLP07196 543 aa29.57■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 KIF15Q9NS87 1388 aa29.57■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.56■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 MBD5Q9P267 1494 aa29.55■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.54■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.53■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 CHD1O14646 1710 aa29.53■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 BCANQ96GW7 911 aa29.53■■■□□ 2.32
CERKL-213ENST00000494398 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.5■■■□□ 2.31
CERKL-213ENST00000494398 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.47■■■□□ 2.31
CERKL-213ENST00000494398 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.47■■■□□ 2.31
CERKL-213ENST00000494398 USP47Q96K76 1375 aa29.46■■■□□ 2.31
CERKL-213ENST00000494398 PREX2Q70Z35 1606 aa29.45■■■□□ 2.31
CERKL-213ENST00000494398 CCDC184Q52MB2 194 aa29.45■■■□□ 2.3
CERKL-213ENST00000494398 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.44■■■□□ 2.3
CERKL-213ENST00000494398 SHROOM2Q13796 1616 aa29.44■■■□□ 2.3
CERKL-213ENST00000494398 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.41■■■□□ 2.3
CERKL-213ENST00000494398 MRS2Q9HD23 443 aa29.4■■■□□ 2.3
CERKL-213ENST00000494398 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.39■■■□□ 2.3
CERKL-213ENST00000494398 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.38■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.37■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 ABCC2Q92887 1545 aa29.36■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.36■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.36■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.35■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.35■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.35■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.35■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.34■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa29.33■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.33■■■□□ 2.29
CERKL-213ENST00000494398 KDM5CP41229 1560 aa29.31■■■□□ 2.28
CERKL-213ENST00000494398 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.28■■■□□ 2.28
CERKL-213ENST00000494398 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.28■■■□□ 2.28
CERKL-213ENST00000494398 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.27■■■□□ 2.28
CERKL-213ENST00000494398 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.26■■■□□ 2.27
CERKL-213ENST00000494398 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CERKL-213ENST00000494398 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.24■■■□□ 2.27
CERKL-213ENST00000494398 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.22■■■□□ 2.27
CERKL-213ENST00000494398 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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