RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494057.5

NICN1-206, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NICN1, Length 645 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-206ENST00000494057 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.08■■□□□ 1.6
NICN1-206ENST00000494057 MLECQ14165 292 aa25.07■■□□□ 1.6
NICN1-206ENST00000494057 ATP10AO60312 1499 aa25.03■■□□□ 1.6
NICN1-206ENST00000494057 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.03■■□□□ 1.6
NICN1-206ENST00000494057 FMN1Q68DA7 1419 aa25.03■■□□□ 1.6
NICN1-206ENST00000494057 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
NICN1-206ENST00000494057 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.01■■□□□ 1.59
NICN1-206ENST00000494057 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25■■□□□ 1.59
NICN1-206ENST00000494057 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
NICN1-206ENST00000494057 CERKQ8TCT0 537 aa24.98■■□□□ 1.59
NICN1-206ENST00000494057 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
NICN1-206ENST00000494057 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.96■■□□□ 1.59
NICN1-206ENST00000494057 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.95■■□□□ 1.58
NICN1-206ENST00000494057 KIF14Q15058 1648 aa24.95■■□□□ 1.58
NICN1-206ENST00000494057 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NICN1-206ENST00000494057 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.92■■□□□ 1.58
NICN1-206ENST00000494057 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.91■■□□□ 1.58
NICN1-206ENST00000494057 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
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NICN1-206ENST00000494057 CLIP1P30622 1438 aa24.9■■□□□ 1.58
NICN1-206ENST00000494057 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NICN1-206ENST00000494057 AFAP1Q8N556 730 aa24.87■■□□□ 1.57
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NICN1-206ENST00000494057 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.86■■□□□ 1.57
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NICN1-206ENST00000494057 REREQ9P2R6 1566 aa24.84■■□□□ 1.57
NICN1-206ENST00000494057 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.84■■□□□ 1.57
NICN1-206ENST00000494057 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.84■■□□□ 1.57
NICN1-206ENST00000494057 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.81■■□□□ 1.56
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NICN1-206ENST00000494057 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.76■■□□□ 1.55
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NICN1-206ENST00000494057 PREX2Q70Z35 1606 aa24.75■■□□□ 1.55
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NICN1-206ENST00000494057 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.7■■□□□ 1.54
NICN1-206ENST00000494057 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.69■■□□□ 1.54
NICN1-206ENST00000494057 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.69■■□□□ 1.54
NICN1-206ENST00000494057 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.66■■□□□ 1.54
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NICN1-206ENST00000494057 NCOA1Q15788 1441 aa24.61■■□□□ 1.53
NICN1-206ENST00000494057 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.61■■□□□ 1.53
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NICN1-206ENST00000494057 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.59■■□□□ 1.53
NICN1-206ENST00000494057 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.59■■□□□ 1.53
NICN1-206ENST00000494057 NPATQ14207 1427 aa24.59■■□□□ 1.53
NICN1-206ENST00000494057 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.58■■□□□ 1.53
NICN1-206ENST00000494057 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.58■■□□□ 1.53
NICN1-206ENST00000494057 MROH2AA6NES4 1674 aa24.57■■□□□ 1.52
NICN1-206ENST00000494057 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.56■■□□□ 1.52
NICN1-206ENST00000494057 ILDR2Q71H61 639 aa24.55■■□□□ 1.52
NICN1-206ENST00000494057 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
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NICN1-206ENST00000494057 ZMYM3Q14202 1370 aa24.53■■□□□ 1.52
NICN1-206ENST00000494057 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
NICN1-206ENST00000494057 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.52■■□□□ 1.52
NICN1-206ENST00000494057 SOCS7O14512 581 aa24.51■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.49■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.49■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 ATP7AQ04656 1500 aa24.49■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 PLXNC1O60486 1568 aa24.48■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 A2MP01023 1474 aa24.45■■□□□ 1.51
NICN1-206ENST00000494057 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 PLA2R1Q13018 1463 aa24.44■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.42■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.42■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 PKD2Q13563 968 aa24.41■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 PTPRKQ15262 1439 aa24.41■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
NICN1-206ENST00000494057 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
NICN1-206ENST00000494057 GGT6Q6P531 493 aa24.38■■□□□ 1.49
NICN1-206ENST00000494057 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.37■■□□□ 1.49
NICN1-206ENST00000494057 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.36■■□□□ 1.49
NICN1-206ENST00000494057 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.35■■□□□ 1.49
NICN1-206ENST00000494057 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.34■■□□□ 1.49
NICN1-206ENST00000494057 TIAM1Q13009 1591 aa24.29■■□□□ 1.48
NICN1-206ENST00000494057 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.29■■□□□ 1.48
NICN1-206ENST00000494057 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.28■■□□□ 1.48
NICN1-206ENST00000494057 MBD5Q9P267 1494 aa24.28■■□□□ 1.48
NICN1-206ENST00000494057 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.27■■□□□ 1.48
NICN1-206ENST00000494057 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
NICN1-206ENST00000494057 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NICN1-206ENST00000494057 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NICN1-206ENST00000494057 CEP162Q5TB80 1403 aa24.22■■□□□ 1.47
NICN1-206ENST00000494057 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.21■■□□□ 1.47
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