RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 ABCC5O15440 1437 aa18.28■□□□□ 0.52
PRAME-213ENST00000492657 DAPK1P53355 1430 aa18.27■□□□□ 0.52
PRAME-213ENST00000492657 NUP160Q12769 1436 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 AKNAQ7Z591 1439 aa18.26■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.25■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.24■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PRAME-213ENST00000492657 KIF14Q15058 1648 aa18.21■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 ROCK1Q13464 1354 aa18.19■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.18■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.17■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.15■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
PRAME-213ENST00000492657 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 ATP10BO94823 1461 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.13■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 ANP32CO43423 234 aa18.12■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 ABCA8O94911 1581 aa18.11■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 NCOA1Q15788 1441 aa18.1■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.09■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.08■□□□□ 0.49
PRAME-213ENST00000492657 BCANQ96GW7 911 aa18.08■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 PTPRGP23470 1445 aa18.07■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 PZPP20742 1482 aa18.06■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.05■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.05■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 CCER2I3L3R5 266 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.04■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.483e-11■□□□□ 9.5
PRAME-213ENST00000492657 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.03■□□□□ 0.48
PRAME-213ENST00000492657 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.02■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 PKD2Q13563 968 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 CHD1O14646 1710 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 ADGRL2O95490 1459 aa18.01■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 TEX14Q8IWB6 1497 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 CROCC2H7BZ55 1655 aa18■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.99■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 TSPY4P0CV99 314 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 TSPY10P0CW01 314 aa17.97■□□□□ 0.47
PRAME-213ENST00000492657 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa17.95■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.95■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 NUP155O75694 1391 aa17.94■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 BCL11AQ9H165 835 aa17.93■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 ANP32EQ9BTT0 268 aa17.92■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 CCDC7Q96M83 1385 aa17.91■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 KIF15Q9NS87 1388 aa17.9■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 MBD5Q9P267 1494 aa17.9■□□□□ 0.46
PRAME-213ENST00000492657 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.89■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.89■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 CCDC184Q52MB2 194 aa17.88■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.88■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.88■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 CNTLNQ9NXG0 1405 aa17.87■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 KIF7Q2M1P5 1343 aa17.87■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 SHROOM2Q13796 1616 aa17.86■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 FKBP8Q14318 412 aa17.85■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 PREX2Q70Z35 1606 aa17.83■□□□□ 0.45
PRAME-213ENST00000492657 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.83■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.82■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.82■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.447e-13■□□□□ 11.3
PRAME-213ENST00000492657 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.81■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.81■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.445e-17■■□□□ 11.4
PRAME-213ENST00000492657 ABCC2Q92887 1545 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 USP47Q96K76 1375 aa17.79■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.78■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.77■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.77■□□□□ 0.44
PRAME-213ENST00000492657 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.76■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.75■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.74■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.74■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.73■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 MRS2Q9HD23 443 aa17.73■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 RGL3Q3MIN7 710 aa17.72■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa17.72■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.71■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
PRAME-213ENST00000492657 NEFLP07196 543 aa17.71■□□□□ 0.42
PRAME-213ENST00000492657 KDM5CP41229 1560 aa17.71■□□□□ 0.42
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