RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, human

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKDCC-208	ENST00000490302	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	MLEC	Q14165	292 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	HSPA2	P54652	639 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PKDCC-208	ENST00000490302	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP10A	O60312	1499 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PKDCC-208	ENST00000490302	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PKDCC-208	ENST00000490302	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PKDCC-208	ENST00000490302	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PKDCC-208	ENST00000490302	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PKDCC-208	ENST00000490302	KIF14	Q15058	1648 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PKDCC-208	ENST00000490302	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PKDCC-208	ENST00000490302	CLIP1	P30622	1438 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PKDCC-208	ENST00000490302	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PKDCC-208	ENST00000490302	AFAP1	Q8N556	730 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PKDCC-208	ENST00000490302	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PKDCC-208	ENST00000490302	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PKDCC-208	ENST00000490302	KDM5C	P41229	1560 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PKDCC-208	ENST00000490302	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.61	■■■□□ 2.17
PKDCC-208	ENST00000490302	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PKDCC-208	ENST00000490302	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PKDCC-208	ENST00000490302	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		28.57	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.55	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.53	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	RERE	Q9P2R6	1566 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.52	■■■□□ 2.16
PKDCC-208	ENST00000490302	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	PREX2	Q70Z35	1606 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	ABCC1	P33527	1531 aa		28.48	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
PKDCC-208	ENST00000490302	AGL	P35573	1532 aa		28.44	■■■□□ 2.14
PKDCC-208	ENST00000490302	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PKDCC-208	ENST00000490302	STRC	Q7RTU9	1775 aa		28.39	■■■□□ 2.14
PKDCC-208	ENST00000490302	C3	P01024	1663 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.38	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		28.34	■■■□□ 2.13
PKDCC-208	ENST00000490302	PTPRT	O14522	1441 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PKDCC-208	ENST00000490302	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PKDCC-208	ENST00000490302	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PKDCC-208	ENST00000490302	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
PKDCC-208	ENST00000490302	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		28.28	■■■□□ 2.12
PKDCC-208	ENST00000490302	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	28.27	■■■□□ 2.12
PKDCC-208	ENST00000490302	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PKDCC-208	ENST00000490302	NPAT	Q14207	1427 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PKDCC-208	ENST00000490302	NCOA1	Q15788	1441 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PKDCC-208	ENST00000490302	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PKDCC-208	ENST00000490302	ZMYM3	Q14202	1370 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PKDCC-208	ENST00000490302	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		28.21	■■■□□ 2.11
PKDCC-208	ENST00000490302	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	MROH2A	A6NES4	1674 aa		28.2	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	ATP7A	Q04656	1500 aa		28.19	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	A2M	P01023	1474 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	28.14	■■■□□ 2.1
PKDCC-208	ENST00000490302	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		28.14	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	PLXNC1	O60486	1568 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	GGT6	Q6P531	493 aa		28.1	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PKDCC-208	ENST00000490302	PTPRK	Q15262	1439 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	TIAM1	Q13009	1591 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	PKD2	Q13563	968 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		28.01	■■■□□ 2.08
PKDCC-208	ENST00000490302	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	MBD5	Q9P267	1494 aa		28	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		27.98	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	CEP162	Q5TB80	1403 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.07
PKDCC-208	ENST00000490302	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PKDCC-208	ENST00000490302	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PKDCC-208	ENST00000490302	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PKDCC-208	ENST00000490302	SOCS7	O14512	581 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PKDCC-208	ENST00000490302	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PKDCC-208	ENST00000490302	KIF3B	O15066	747 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PKDCC-208	ENST00000490302	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		27.87	■■■□□ 2.05

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