RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489100.5

FAM107B-223, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-223	ENST00000489100	SOCS7	O14512	581 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		11.92	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	EEA1	Q15075	1411 aa		11.91	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		11.9	□□□□□ -0.5
FAM107B-223	ENST00000489100	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP10A	O60312	1499 aa		11.88	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		11.87	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	11.86	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	ILDR2	Q71H61	639 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	PLCH2	O75038	1416 aa		11.86	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		11.84	□□□□□ -0.51
FAM107B-223	ENST00000489100	RICTOR	Q6R327	1708 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	CLIP1	P30622	1438 aa		11.83	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		11.82	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		11.81	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.8	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		11.79	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.78	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	PTPRT	O14522	1441 aa		11.77	□□□□□ -0.52
FAM107B-223	ENST00000489100	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		11.76	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	KIF14	Q15058	1648 aa		11.75	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		11.74	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.72	□□□□□ -0.53
FAM107B-223	ENST00000489100	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		11.7	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	PKD2	Q13563	968 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	KDM5C	P41229	1560 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	GGT6	Q6P531	493 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	AGL	P35573	1532 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	NPAT	Q14207	1427 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	STRC	Q7RTU9	1775 aa		11.66	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	TOM1	O60784	492 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.65	□□□□□ -0.54
FAM107B-223	ENST00000489100	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		11.64	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	C3	P01024	1663 aa		11.62	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	ABCC1	P33527	1531 aa		11.61	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	HSPA1L	P34931	641 aa		11.6	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.59	□□□□□ -0.55
FAM107B-223	ENST00000489100	PLA2R1	Q13018	1463 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.58	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	PREX2	Q70Z35	1606 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	A2M	P01023	1474 aa		11.57	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.56	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		11.55	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		11.55	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	PTPRK	Q15262	1439 aa		11.55	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.54	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		11.54	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.54	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		11.54	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	TNR	Q92752	1358 aa		11.54	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		11.53	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	MROH2A	A6NES4	1674 aa		11.52	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		11.52	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		11.52	□□□□□ -0.56
FAM107B-223	ENST00000489100	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	KIF3B	O15066	747 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		11.52	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	CPS1	P31327	1500 aa		11.51	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		11.5	□□□□□ -0.57
FAM107B-223	ENST00000489100	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		11.5	□□□□□ -0.57

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