RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487485.1

TOP3B-216, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 725 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-216ENST00000487485 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.99■□□□□ 0.31
TOP3B-216ENST00000487485 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.99■□□□□ 0.31
TOP3B-216ENST00000487485 HECW1Q76N89 1606 aa16.98■□□□□ 0.31
TOP3B-216ENST00000487485 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.96■□□□□ 0.31
TOP3B-216ENST00000487485 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.96■□□□□ 0.31
TOP3B-216ENST00000487485 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.96■□□□□ 0.3
TOP3B-216ENST00000487485 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.95■□□□□ 0.3
TOP3B-216ENST00000487485 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.95■□□□□ 0.3
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TOP3B-216ENST00000487485 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.89■□□□□ 0.3
TOP3B-216ENST00000487485 ATP10AO60312 1499 aa16.88■□□□□ 0.29
TOP3B-216ENST00000487485 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.87■□□□□ 0.29
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TOP3B-216ENST00000487485 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
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TOP3B-216ENST00000487485 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.84■□□□□ 0.29
TOP3B-216ENST00000487485 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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TOP3B-216ENST00000487485 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.8■□□□□ 0.28
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TOP3B-216ENST00000487485 SOCS7O14512 581 aa16.77■□□□□ 0.28
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TOP3B-216ENST00000487485 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.77■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.76■□□□□ 0.27
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TOP3B-216ENST00000487485 MAP3K1Q13233 1512 aa16.75■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 KIF14Q15058 1648 aa16.74■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.74■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.74■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.72■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 KDM5CP41229 1560 aa16.72■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 PTPRTO14522 1441 aa16.71■□□□□ 0.27
TOP3B-216ENST00000487485 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.7■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.7■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.69■□□□□ 0.26
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TOP3B-216ENST00000487485 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.69■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.68■□□□□ 0.26
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TOP3B-216ENST00000487485 ABCA6Q8N139 1617 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.66■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 AGLP35573 1532 aa16.65■□□□□ 0.26
TOP3B-216ENST00000487485 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.63■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 NCOA1Q15788 1441 aa16.62■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 NCOA2Q15596 1464 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.61■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 ABCC1P33527 1531 aa16.6■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 PREX2Q70Z35 1606 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 ZMYM3Q14202 1370 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.59■□□□□ 0.25
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.56■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 NPATQ14207 1427 aa16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.52■□□□□ 0.24
TOP3B-216ENST00000487485 PKD2Q13563 968 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 GGT6Q6P531 493 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 MYOM3Q5VTT5 1437 aa16.5■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 MROH2AA6NES4 1674 aa16.49■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.48■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 PTPRKQ15262 1439 aa16.47■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 MIA2Q96PC5 1412 aa16.46■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TOP3B-216ENST00000487485 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 A2MP01023 1474 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 PLA2R1Q13018 1463 aa16.45■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.44■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 ATP7AQ04656 1500 aa16.43■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.42■□□□□ 0.22
TOP3B-216ENST00000487485 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.42■□□□□ 0.22
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