RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482429.1

LTB-212, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 2

Gene LTB, Length 1,388 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-212ENST00000482429 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.35■■■■□ 3.09
LTB-212ENST00000482429 ATP10AO60312 1499 aa34.33■■■■□ 3.09
LTB-212ENST00000482429 MLECQ14165 292 aa34.33■■■■□ 3.09
LTB-212ENST00000482429 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa34.31■■■■□ 3.08
LTB-212ENST00000482429 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.31■■■■□ 3.08
LTB-212ENST00000482429 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.29■■■■□ 3.08
LTB-212ENST00000482429 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.29■■■■□ 3.08
LTB-212ENST00000482429 FMN1Q68DA7 1419 aa34.29■■■■□ 3.08
LTB-212ENST00000482429 CERKQ8TCT0 537 aa34.25■■■■□ 3.07
LTB-212ENST00000482429 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.24■■■■□ 3.07
LTB-212ENST00000482429 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
LTB-212ENST00000482429 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.23■■■■□ 3.07
LTB-212ENST00000482429 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.2■■■■□ 3.07
LTB-212ENST00000482429 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
LTB-212ENST00000482429 KIF14Q15058 1648 aa34.18■■■■□ 3.06
LTB-212ENST00000482429 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.17■■■■□ 3.06
LTB-212ENST00000482429 KDM5CP41229 1560 aa34.16■■■■□ 3.06
LTB-212ENST00000482429 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
LTB-212ENST00000482429 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
LTB-212ENST00000482429 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
LTB-212ENST00000482429 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.12■■■■□ 3.05
LTB-212ENST00000482429 CLIP1P30622 1438 aa34.1■■■■□ 3.05
LTB-212ENST00000482429 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
LTB-212ENST00000482429 AFAP1Q8N556 730 aa34.09■■■■□ 3.05
LTB-212ENST00000482429 REREQ9P2R6 1566 aa34.08■■■■□ 3.05
LTB-212ENST00000482429 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.07■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 STRCQ7RTU9 1775 aa34.06■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.06■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa34.04■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.03■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa34.02■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.02■■■■□ 3.04
LTB-212ENST00000482429 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34■■■■□ 3.03
LTB-212ENST00000482429 ABCA6Q8N139 1617 aa33.98■■■■□ 3.03
LTB-212ENST00000482429 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.98■■■■□ 3.03
LTB-212ENST00000482429 AGLP35573 1532 aa33.96■■■■□ 3.03
LTB-212ENST00000482429 C3P01024 1663 aa33.95■■■■□ 3.03
LTB-212ENST00000482429 PREX2Q70Z35 1606 aa33.95■■■■□ 3.02
LTB-212ENST00000482429 ABCC1P33527 1531 aa33.93■■■■□ 3.02
LTB-212ENST00000482429 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.9■■■■□ 3.02
LTB-212ENST00000482429 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.89■■■■□ 3.02
LTB-212ENST00000482429 PTPRTO14522 1441 aa33.89■■■■□ 3.02
LTB-212ENST00000482429 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.89■■■■□ 3.02
LTB-212ENST00000482429 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
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LTB-212ENST00000482429 DISP3Q9P2K9 1392 aa33.76■■■□□ 2.99
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LTB-212ENST00000482429 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.73■■■□□ 2.99
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LTB-212ENST00000482429 MROH2AA6NES4 1674 aa33.72■■■□□ 2.99
LTB-212ENST00000482429 NPATQ14207 1427 aa33.71■■■□□ 2.99
LTB-212ENST00000482429 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.7■■■□□ 2.99
LTB-212ENST00000482429 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.69■■■□□ 2.98
LTB-212ENST00000482429 ILDR2Q71H61 639 aa33.66■■■□□ 2.98
LTB-212ENST00000482429 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.63■■■□□ 2.97
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LTB-212ENST00000482429 ZMYM3Q14202 1370 aa33.62■■■□□ 2.97
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LTB-212ENST00000482429 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
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LTB-212ENST00000482429 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.58■■■□□ 2.97
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LTB-212ENST00000482429 PLXNC1O60486 1568 aa33.56■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa33.56■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP33.53■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 A2MP01023 1474 aa33.51■■■□□ 2.96
LTB-212ENST00000482429 PLA2R1Q13018 1463 aa33.5■■■□□ 2.95
LTB-212ENST00000482429 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
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LTB-212ENST00000482429 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.47■■■□□ 2.95
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LTB-212ENST00000482429 PTPRKQ15262 1439 aa33.46■■■□□ 2.95
LTB-212ENST00000482429 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.46■■■□□ 2.95
LTB-212ENST00000482429 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
LTB-212ENST00000482429 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.45■■■□□ 2.94
LTB-212ENST00000482429 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
LTB-212ENST00000482429 ADGBQ8N7X0 1667 aa33.42■■■□□ 2.94
LTB-212ENST00000482429 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
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LTB-212ENST00000482429 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.37■■■□□ 2.93
LTB-212ENST00000482429 UBAP1LF5GYI3 381 aa33.34■■■□□ 2.93
LTB-212ENST00000482429 MBD5Q9P267 1494 aa33.3■■■□□ 2.92
LTB-212ENST00000482429 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.3■■■□□ 2.92
LTB-212ENST00000482429 TIAM1Q13009 1591 aa33.3■■■□□ 2.92
LTB-212ENST00000482429 A2ML1A8K2U0 1454 aa33.3■■■□□ 2.92
LTB-212ENST00000482429 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
LTB-212ENST00000482429 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP33.27■■■□□ 2.92
LTB-212ENST00000482429 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.24■■■□□ 2.91
LTB-212ENST00000482429 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
LTB-212ENST00000482429 FAM135AQ9P2D6 1515 aa33.2■■■□□ 2.91
LTB-212ENST00000482429 CEP162Q5TB80 1403 aa33.2■■■□□ 2.91
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