RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FMN1Q68DA7 1419 aa22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 JPH4Q96JJ6 628 aa21.99■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCAPD3P42695 1498 aa21.97■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.97■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.95■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.94■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.92■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KANK1Q14678 1352 aa21.91■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NRDCO43847 1150 aa21.9■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FGD1P98174 961 aa21.9■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GGT6Q6P531 493 aa21.9■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNJ4P48050 445 aa21.89■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMF1P82094 1093 aa21.89■■□□□ 1.1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.89■■□□□ 1.1
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.89■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.89■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.88■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.86■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.86■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POGKQ9P215 609 aa21.85■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.83■■□□□ 1.09
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCCP23508 829 aa21.82■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.81■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.8■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.8■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSCARQ8IYS5 282 aa21.8■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GBP4Q96PP9 640 aa21.79■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTMSP20962 102 aa21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKD2Q13563 968 aa21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.76■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP44Q96MT7 982 aa21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MORC1Q86VD1 984 aa21.75■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARID3AQ99856 593 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXD1Q16676 465 aa21.74■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRGP23470 1445 aa21.73■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGF1RP08069 1367 aa21.72■■□□□ 1.07
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.7■■□□□ 1.07
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.7■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.7■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NESP48681 1621 aa21.69■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.69■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 APBB1O00213 710 aa21.68■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF3BO15066 747 aa21.68■■□□□ 1.06
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP155O75694 1391 aa21.68■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.65■■□□□ 1.06
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.61■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.61■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.6■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa21.6■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOX12O15370 315 aa21.58■■□□□ 1.05
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK26Q9P289 416 aa21.58■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMGXB3Q12766 1538 aa21.54■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPHP1O15259 732 aa21.53■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.52■■□□□ 1.04
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRIN2BQ13224 1484 aa21.5■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 USP35Q9P2H5 1018 aa21.48■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.47■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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