RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478849.1

OPN3-205, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 3

Gene OPN3, Length 880 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-205ENST00000478849 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 HECW1Q76N89 1606 aa40.51■■■■■ 4.08
OPN3-205ENST00000478849 MLECQ14165 292 aa40.49■■■■■ 4.07
OPN3-205ENST00000478849 HSPA2P54652 639 aa40.48■■■■■ 4.07
OPN3-205ENST00000478849 FMN1Q68DA7 1419 aa40.44■■■■■ 4.06
OPN3-205ENST00000478849 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.4■■■■■ 4.06
OPN3-205ENST00000478849 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.4■■■■■ 4.06
OPN3-205ENST00000478849 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
OPN3-205ENST00000478849 ATP10AO60312 1499 aa40.34■■■■■ 4.05
OPN3-205ENST00000478849 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.33■■■■■ 4.05
OPN3-205ENST00000478849 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.32■■■■■ 4.04
OPN3-205ENST00000478849 KIF14Q15058 1648 aa40.31■■■■■ 4.04
OPN3-205ENST00000478849 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.29■■■■■ 4.04
OPN3-205ENST00000478849 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.25■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 AFAP1Q8N556 730 aa40.22■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.21■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa40.2■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.2■■■■■ 4.03
OPN3-205ENST00000478849 CLIP1P30622 1438 aa40.18■■■■■ 4.02
OPN3-205ENST00000478849 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
OPN3-205ENST00000478849 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.14■■■■■ 4.02
OPN3-205ENST00000478849 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.13■■■■■ 4.02
OPN3-205ENST00000478849 KDM5CP41229 1560 aa40.13■■■■■ 4.01
OPN3-205ENST00000478849 CERKQ8TCT0 537 aa40.1■■■■■ 4.01
OPN3-205ENST00000478849 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.05■■■■■ 4
OPN3-205ENST00000478849 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.04■■■■■ 4
OPN3-205ENST00000478849 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.03■■■■■ 4
OPN3-205ENST00000478849 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.99■■■■□ 3.99
OPN3-205ENST00000478849 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.98■■■■□ 3.99
OPN3-205ENST00000478849 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.98■■■■□ 3.99
OPN3-205ENST00000478849 ABCA6Q8N139 1617 aa39.97■■■■□ 3.99
OPN3-205ENST00000478849 REREQ9P2R6 1566 aa39.96■■■■□ 3.99
OPN3-205ENST00000478849 PREX2Q70Z35 1606 aa39.94■■■■□ 3.99
OPN3-205ENST00000478849 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.94■■■■□ 3.98
OPN3-205ENST00000478849 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.93■■■■□ 3.98
OPN3-205ENST00000478849 ABCC1P33527 1531 aa39.93■■■■□ 3.98
OPN3-205ENST00000478849 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.88■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 STRCQ7RTU9 1775 aa39.87■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.86■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 AGLP35573 1532 aa39.86■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 C3P01024 1663 aa39.83■■■■□ 3.97
OPN3-205ENST00000478849 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.8■■■■□ 3.96
OPN3-205ENST00000478849 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.79■■■■□ 3.96
OPN3-205ENST00000478849 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
OPN3-205ENST00000478849 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.76■■■■□ 3.96
OPN3-205ENST00000478849 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.7■■■■□ 3.95
OPN3-205ENST00000478849 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.69■■■■□ 3.94
OPN3-205ENST00000478849 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
OPN3-205ENST00000478849 PTPRTO14522 1441 aa39.67■■■■□ 3.94
OPN3-205ENST00000478849 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.66■■■■□ 3.94
OPN3-205ENST00000478849 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.65■■■■□ 3.94
OPN3-205ENST00000478849 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
OPN3-205ENST00000478849 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 ZMYM3Q14202 1370 aa39.56■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 NCOA1Q15788 1441 aa39.56■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 NPATQ14207 1427 aa39.54■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.54■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 ATP7AQ04656 1500 aa39.52■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 CCNB3Q8WWL7 1395 aa39.52■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 MROH2AA6NES4 1674 aa39.51■■■■□ 3.92
OPN3-205ENST00000478849 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.49■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.49■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.47■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 A2MP01023 1474 aa39.46■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.45■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.45■■■■□ 3.91
OPN3-205ENST00000478849 PLXNC1O60486 1568 aa39.44■■■■□ 3.9
OPN3-205ENST00000478849 GGT6Q6P531 493 aa39.42■■■■□ 3.9
OPN3-205ENST00000478849 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
OPN3-205ENST00000478849 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.4■■■■□ 3.9
OPN3-205ENST00000478849 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
OPN3-205ENST00000478849 ILDR2Q71H61 639 aa39.35■■■■□ 3.89
OPN3-205ENST00000478849 PTPRKQ15262 1439 aa39.34■■■■□ 3.89
OPN3-205ENST00000478849 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.33■■■■□ 3.89
OPN3-205ENST00000478849 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.3■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 TIAM1Q13009 1591 aa39.29■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.28■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 MBD5Q9P267 1494 aa39.28■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.27■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.26■■■■□ 3.88
OPN3-205ENST00000478849 PKD2Q13563 968 aa39.25■■■■□ 3.87
OPN3-205ENST00000478849 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.24■■■■□ 3.87
OPN3-205ENST00000478849 PLA2R1Q13018 1463 aa39.24■■■■□ 3.87
OPN3-205ENST00000478849 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.2■■■■□ 3.87
OPN3-205ENST00000478849 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.19■■■■□ 3.86
OPN3-205ENST00000478849 CEP162Q5TB80 1403 aa39.19■■■■□ 3.86
OPN3-205ENST00000478849 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.17■■■■□ 3.86
OPN3-205ENST00000478849 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.16■■■■□ 3.86
OPN3-205ENST00000478849 SOCS7O14512 581 aa39.13■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.12■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.11■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 KIF3BO15066 747 aa39.1■■■■□ 3.85
OPN3-205ENST00000478849 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms