RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477216.1

SKIL-208, Transcript of SKI like proto-oncogene, humanhuman

TSL 4

Gene SKIL, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIL-208ENST00000477216 FMN1Q68DA7 1419 aa40.03■■■■■ 4
SKIL-208ENST00000477216 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
SKIL-208ENST00000477216 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.02■■■■■ 4
SKIL-208ENST00000477216 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.02■■■■■ 4
SKIL-208ENST00000477216 HECW1Q76N89 1606 aa40.02■■■■■ 4
SKIL-208ENST00000477216 HSPA2P54652 639 aa40.01■■■■■ 4
SKIL-208ENST00000477216 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40■■■■□ 3.99
SKIL-208ENST00000477216 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.99■■■■□ 3.99
SKIL-208ENST00000477216 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.98■■■■□ 3.99
SKIL-208ENST00000477216 ATP10AO60312 1499 aa39.96■■■■□ 3.99
SKIL-208ENST00000477216 MLECQ14165 292 aa39.95■■■■□ 3.99
SKIL-208ENST00000477216 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.94■■■■□ 3.98
SKIL-208ENST00000477216 CERKQ8TCT0 537 aa39.93■■■■□ 3.98
SKIL-208ENST00000477216 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
SKIL-208ENST00000477216 DMRT2Q9Y5R5 561 aa39.89■■■■□ 3.98
SKIL-208ENST00000477216 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.88■■■■□ 3.97
SKIL-208ENST00000477216 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.88■■■■□ 3.97
SKIL-208ENST00000477216 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.86■■■■□ 3.97
SKIL-208ENST00000477216 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.85■■■■□ 3.97
SKIL-208ENST00000477216 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.83■■■■□ 3.97
SKIL-208ENST00000477216 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
SKIL-208ENST00000477216 KIF14Q15058 1648 aa39.78■■■■□ 3.96
SKIL-208ENST00000477216 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.77■■■■□ 3.96
SKIL-208ENST00000477216 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
SKIL-208ENST00000477216 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.71■■■■□ 3.95
SKIL-208ENST00000477216 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.71■■■■□ 3.95
SKIL-208ENST00000477216 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.71■■■■□ 3.95
SKIL-208ENST00000477216 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
SKIL-208ENST00000477216 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.71■■■■□ 3.95
SKIL-208ENST00000477216 KDM5CP41229 1560 aa39.68■■■■□ 3.94
SKIL-208ENST00000477216 REREQ9P2R6 1566 aa39.66■■■■□ 3.94
SKIL-208ENST00000477216 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP39.65■■■■□ 3.94
SKIL-208ENST00000477216 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.63■■■■□ 3.93
SKIL-208ENST00000477216 AFAP1Q8N556 730 aa39.61■■■■□ 3.93
SKIL-208ENST00000477216 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.6■■■■□ 3.93
SKIL-208ENST00000477216 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.58■■■■□ 3.93
SKIL-208ENST00000477216 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39.57■■■■□ 3.92
SKIL-208ENST00000477216 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.56■■■■□ 3.92
SKIL-208ENST00000477216 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.54■■■■□ 3.92
SKIL-208ENST00000477216 AGLP35573 1532 aa39.52■■■■□ 3.92
SKIL-208ENST00000477216 PTPRTO14522 1441 aa39.51■■■■□ 3.92
SKIL-208ENST00000477216 STRCQ7RTU9 1775 aa39.51■■■■□ 3.91
SKIL-208ENST00000477216 CNTLNQ9NXG0 1405 aa39.48■■■■□ 3.91
SKIL-208ENST00000477216 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.45■■■■□ 3.91
SKIL-208ENST00000477216 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.44■■■■□ 3.9
SKIL-208ENST00000477216 PREX2Q70Z35 1606 aa39.42■■■■□ 3.9
SKIL-208ENST00000477216 ABCA6Q8N139 1617 aa39.42■■■■□ 3.9
SKIL-208ENST00000477216 C3P01024 1663 aa39.41■■■■□ 3.9
SKIL-208ENST00000477216 ABCC1P33527 1531 aa39.4■■■■□ 3.9
SKIL-208ENST00000477216 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.4■■■■□ 3.9
SKIL-208ENST00000477216 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.36■■■■□ 3.89
SKIL-208ENST00000477216 ITSN2Q9NZM3 1697 aa39.35■■■■□ 3.89
SKIL-208ENST00000477216 NPATQ14207 1427 aa39.29■■■■□ 3.88
SKIL-208ENST00000477216 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.26■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 TIAM1Q13009 1591 aa39.25■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 NCOA1Q15788 1441 aa39.25■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 SOCS7O14512 581 aa39.24■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 MROH2AA6NES4 1674 aa39.23■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 MTUS2Q5JR59 1369 aa39.21■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 MAP3K1Q13233 1512 aa39.2■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa39.2■■■■□ 3.87
SKIL-208ENST00000477216 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.17■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.16■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.16■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa39.15■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 APLP2Q06481 763 aa39.15■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.15■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 ZMYM3Q14202 1370 aa39.14■■■■□ 3.86
SKIL-208ENST00000477216 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.12■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.12■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.11■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.1■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 ILDR2Q71H61 639 aa39.09■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.09■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 PKD2Q13563 968 aa39.08■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa39.08■■■■□ 3.85
SKIL-208ENST00000477216 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.05■■■■□ 3.84
SKIL-208ENST00000477216 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
SKIL-208ENST00000477216 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
SKIL-208ENST00000477216 PLA2R1Q13018 1463 aa39.03■■■■□ 3.84
SKIL-208ENST00000477216 ATP7AQ04656 1500 aa39.03■■■■□ 3.84
SKIL-208ENST00000477216 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.02■■■■□ 3.84
SKIL-208ENST00000477216 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP39■■■■□ 3.83
SKIL-208ENST00000477216 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.99■■■■□ 3.83
SKIL-208ENST00000477216 A2MP01023 1474 aa38.98■■■■□ 3.83
SKIL-208ENST00000477216 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.97■■■■□ 3.83
SKIL-208ENST00000477216 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.96■■■■□ 3.83
SKIL-208ENST00000477216 PLXNC1O60486 1568 aa38.96■■■■□ 3.83
SKIL-208ENST00000477216 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP38.94■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP38.94■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.92■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 NCOA2Q15596 1464 aa38.92■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa38.91■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.9■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 PTPRKQ15262 1439 aa38.89■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 UBAP1LF5GYI3 381 aa38.89■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 GGT6Q6P531 493 aa38.89■■■■□ 3.82
SKIL-208ENST00000477216 ADGBQ8N7X0 1667 aa38.87■■■■□ 3.81
SKIL-208ENST00000477216 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
SKIL-208ENST00000477216 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP38.86■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1660.4 ms