RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	NUDC	Q9Y266	331 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	STAC3	Q96MF2	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	5.79	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	TPM2	P07951	284 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	SCRIB	Q14160	1630 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	MRS2	Q9HD23	443 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		5.78	□□□□□ -1.48
RBMS1-208	ENST00000474147	CAPN15	O75808	1086 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	PANK2	Q9BZ23	570 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	NCOA2	Q15596	1464 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	ERBB4	Q15303	1308 aa		5.77	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	FSD2	A1L4K1	749 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	SKAP1	Q86WV1	359 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	KLHL34	Q8N239	644 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	ARAP1	Q96P48	1450 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	ESPN	B1AK53	854 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	RIPK4	P57078	832 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	SYNJ1	O43426	1573 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	ARX	Q96QS3	562 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM51	Q9NW97	253 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	TONSL	Q96HA7	1378 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	C8orf34	Q49A92	452 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RBMS1-208	ENST00000474147	DMTN	Q08495	405 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	MAP7D2	Q96T17	732 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM161A	Q3B820	660 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	MRE11	P49959	708 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	TERF1	P54274	439 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC7	Q96M83	1385 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	NCOA1	Q15788	1441 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	MAP3K1	Q13233	1512 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	OFD1	O75665	1012 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	VGLL3	A8MV65	326 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	USP19	O94966	1318 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	5.66	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	MCM4	P33991	863 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	ARID3A	Q99856	593 aa		5.65	□□□□□ -1.5
RBMS1-208	ENST00000474147	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF20A	O95235	890 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBMS1-208	ENST00000474147	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	5.65	□□□□□ -1.51
RBMS1-208	ENST00000474147	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.51
RBMS1-208	ENST00000474147	CRBN	Q96SW2	442 aa		5.65	□□□□□ -1.51
RBMS1-208	ENST00000474147	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
RBMS1-208	ENST00000474147	PLIN1	O60240	522 aa		5.64	□□□□□ -1.51

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