RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 ABCC5O15440 1437 aa24.27■■□□□ 1.48
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USP20-204ENST00000472108 NAIPQ13075 1403 aa24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 AKNAQ7Z591 1439 aa24.23■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 PREX2Q70Z35 1606 aa24.23■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.23■■□□□ 1.47
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USP20-204ENST00000472108 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.14■■□□□ 1.45
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USP20-204ENST00000472108 TSPY4P0CV99 314 aa24.07■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 TSPY10P0CW01 314 aa24.07■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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USP20-204ENST00000472108 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.05■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.05■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.04■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 MAPKBP1O60336 1514 aa24.04■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.03■■□□□ 1.44
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USP20-204ENST00000472108 FANCAO15360 1455 aa23.95■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 TRIM52Q96A61 297 aa23.95■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.95■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.92■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 CD109Q6YHK3 1445 aa23.92■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 KIF15Q9NS87 1388 aa23.91■■□□□ 1.42
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USP20-204ENST00000472108 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.83■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 GLI2P10070 1586 aa23.82■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.81■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.81■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 NEUROD1Q13562 356 aa23.8■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
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USP20-204ENST00000472108 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.77■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.76■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 NEO1Q92859 1461 aa23.76■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.74■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 NUP155O75694 1391 aa23.74■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.73■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.73■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 ERBINQ96RT1 1412 aa23.72■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 DIP2BQ9P265 1576 aa23.72■■□□□ 1.39
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USP20-204ENST00000472108 FOXD1Q16676 465 aa23.7■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.7■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.68■■□□□ 1.38
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USP20-204ENST00000472108 UNC13BO14795 1591 aa23.65■■□□□ 1.38
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USP20-204ENST00000472108 TONSLQ96HA7 1378 aa23.65■■□□□ 1.38
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USP20-204ENST00000472108 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.62■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.62■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.61■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.6■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 RAPGEF3O95398 923 aa23.58■■□□□ 1.37
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USP20-204ENST00000472108 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.57■■□□□ 1.36
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