RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472108.1

USP20-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 1,811 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-204ENST00000472108 ABCC5O15440 1437 aa24.27■■□□□ 1.48
USP20-204ENST00000472108 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.25■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 NAIPQ13075 1403 aa24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.24■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 AKNAQ7Z591 1439 aa24.23■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 PREX2Q70Z35 1606 aa24.23■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.23■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.21■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 ROCK1Q13464 1354 aa24.21■■□□□ 1.47
USP20-204ENST00000472108 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.19■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 ASXL2Q76L83 1435 aa24.18■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.17■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 PLCH2O75038 1416 aa24.17■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.15■■□□□ 1.46
USP20-204ENST00000472108 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.14■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.14■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.13■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 MBD5Q9P267 1494 aa24.13■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.12■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.12■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.11■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.1■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 ADGRL2O95490 1459 aa24.1■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.1■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 NCOA1Q15788 1441 aa24.09■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.09■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.09■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.08■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.08■■□□□ 1.45
USP20-204ENST00000472108 TSPY4P0CV99 314 aa24.07■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 TSPY10P0CW01 314 aa24.07■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.06■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.05■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.05■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.04■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 MAPKBP1O60336 1514 aa24.04■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.03■■□□□ 1.44
USP20-204ENST00000472108 KDM6BO15054 1643 aa24.01■■□□□ 1.43
USP20-204ENST00000472108 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.98■■□□□ 1.43
USP20-204ENST00000472108 ABCC1P33527 1531 aa23.97■■□□□ 1.43
USP20-204ENST00000472108 FANCAO15360 1455 aa23.95■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 TRIM52Q96A61 297 aa23.95■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.95■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.92■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 CD109Q6YHK3 1445 aa23.92■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 KIF15Q9NS87 1388 aa23.91■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.89■■□□□ 1.42
USP20-204ENST00000472108 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.88■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 ADGRL1O94910 1474 aa23.85■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.84■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 PLXNC1O60486 1568 aa23.84■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.83■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 AFAP1Q8N556 730 aa23.83■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.83■■□□□ 1.41
USP20-204ENST00000472108 GLI2P10070 1586 aa23.82■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.81■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.81■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 NEUROD1Q13562 356 aa23.8■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 PZPP20742 1482 aa23.78■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.77■■□□□ 1.4
USP20-204ENST00000472108 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.76■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 NEO1Q92859 1461 aa23.76■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.74■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 NUP155O75694 1391 aa23.74■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.73■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.73■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 ERBINQ96RT1 1412 aa23.72■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 DIP2BQ9P265 1576 aa23.72■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.72■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
USP20-204ENST00000472108 ATP7AQ04656 1500 aa23.7■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 FOXD1Q16676 465 aa23.7■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.7■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.68■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 PKD2Q13563 968 aa23.66■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 UNC13BO14795 1591 aa23.65■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 KDM5CP41229 1560 aa23.65■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 TONSLQ96HA7 1378 aa23.65■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.64■■□□□ 1.38
USP20-204ENST00000472108 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.62■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.62■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.61■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.6■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 RAPGEF3O95398 923 aa23.58■■□□□ 1.37
USP20-204ENST00000472108 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
USP20-204ENST00000472108 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms