RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 NAIPQ13075 1403 aa19.8■□□□□ 0.76
GPC1-208ENST00000469694 MIA2Q96PC5 1412 aa19.79■□□□□ 0.76
GPC1-208ENST00000469694 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
GPC1-208ENST00000469694 SHROOM2Q13796 1616 aa19.74■□□□□ 0.75
GPC1-208ENST00000469694 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
GPC1-208ENST00000469694 UACAQ9BZF9 1416 aa19.72■□□□□ 0.75
GPC1-208ENST00000469694 ABCC5O15440 1437 aa19.7■□□□□ 0.74
GPC1-208ENST00000469694 DAPK1P53355 1430 aa19.7■□□□□ 0.74
GPC1-208ENST00000469694 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.69■□□□□ 0.74
GPC1-208ENST00000469694 KDM6BO15054 1643 aa19.69■□□□□ 0.74
GPC1-208ENST00000469694 TRIM52Q96A61 297 aa19.69■□□□□ 0.74
GPC1-208ENST00000469694 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa19.67■□□□□ 0.74
GPC1-208ENST00000469694 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.64■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 KCNH8Q96L42 1107 aa19.64■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.64■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 BCANQ96GW7 911 aa19.63■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 FOXD1Q16676 465 aa19.61■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.59■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 FKBP8Q14318 412 aa19.59■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 ITSN2Q9NZM3 1697 aa19.59■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 ABCC2Q92887 1545 aa19.59■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa19.58■□□□□ 0.73
GPC1-208ENST00000469694 GCC2Q8IWJ2 1684 aa19.58■□□□□ 0.72
GPC1-208ENST00000469694 AKNAQ7Z591 1439 aa19.57■□□□□ 0.72
GPC1-208ENST00000469694 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.56■□□□□ 0.72
GPC1-208ENST00000469694 ROCK1Q13464 1354 aa19.55■□□□□ 0.72
GPC1-208ENST00000469694 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19.55■□□□□ 0.72
GPC1-208ENST00000469694 NCOA1Q15788 1441 aa19.53■□□□□ 0.72
GPC1-208ENST00000469694 OSCARQ8IYS5 282 aa19.51■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.51■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 TONSLQ96HA7 1378 aa19.5■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 TSPY4P0CV99 314 aa19.47■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 TSPY10P0CW01 314 aa19.47■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.46■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.46■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.46■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 MSH5O43196 834 aa19.46■□□□□ 0.71
GPC1-208ENST00000469694 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.45■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.45■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.45■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 MBD5Q9P267 1494 aa19.45■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa19.44■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 CROCC2H7BZ55 1655 aa19.43■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 NEFLP07196 543 aa19.43■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.43■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 PREX2Q70Z35 1606 aa19.43■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 ADGRL2O95490 1459 aa19.42■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa19.42■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.41■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 ADGBQ8N7X0 1667 aa19.39■□□□□ 0.7
GPC1-208ENST00000469694 KIF15Q9NS87 1388 aa19.39■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 PZPP20742 1482 aa19.37■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.37■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.36■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 SHANK2Q9UPX8 1470 aa19.36■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.35■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 PKD2Q13563 968 aa19.34■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.34■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.34■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 NUP155O75694 1391 aa19.34■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 PLCH2O75038 1416 aa19.34■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.34■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.33■□□□□ 0.69
GPC1-208ENST00000469694 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19.33■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.31■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.29■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 AFAP1Q8N556 730 aa19.29■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 ASXL2Q76L83 1435 aa19.28■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.28■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa19.28■□□□□ 0.68
GPC1-208ENST00000469694 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa19.26■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.25■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 CCER2I3L3R5 266 aa19.25■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 MYT1LQ9UL68 1186 aa19.23■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 ERICH6Q7L0X2 663 aa19.23■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.22■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 NBPF8Q3BBV2 869 aa19.22■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 ABCC1P33527 1531 aa19.21■□□□□ 0.67
GPC1-208ENST00000469694 FANCAO15360 1455 aa19.19■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.19■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.18■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.16■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.14■□□□□ 0.66
GPC1-208ENST00000469694 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.14■□□□□ 0.65
GPC1-208ENST00000469694 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.13■□□□□ 0.65
GPC1-208ENST00000469694 ANP32CO43423 234 aa19.13■□□□□ 0.65
GPC1-208ENST00000469694 KDM5DQ9BY66 1539 aa19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms