RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.88■■■■□ 3.49
OPN3-204ENST00000469376 PTPRKQ15262 1439 aa36.88■■■■□ 3.49
OPN3-204ENST00000469376 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
OPN3-204ENST00000469376 NAIPQ13075 1403 aa36.83■■■■□ 3.49
OPN3-204ENST00000469376 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
OPN3-204ENST00000469376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.8■■■■□ 3.48
OPN3-204ENST00000469376 TONSLQ96HA7 1378 aa36.77■■■■□ 3.48
OPN3-204ENST00000469376 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.77■■■■□ 3.48
OPN3-204ENST00000469376 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
OPN3-204ENST00000469376 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
OPN3-204ENST00000469376 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.7■■■■□ 3.47
OPN3-204ENST00000469376 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.68■■■■□ 3.46
OPN3-204ENST00000469376 AKNAQ7Z591 1439 aa36.67■■■■□ 3.46
OPN3-204ENST00000469376 KIF14Q15058 1648 aa36.67■■■■□ 3.46
OPN3-204ENST00000469376 KCNH8Q96L42 1107 aa36.62■■■■□ 3.45
OPN3-204ENST00000469376 MIA2Q96PC5 1412 aa36.61■■■■□ 3.45
OPN3-204ENST00000469376 CCER2I3L3R5 266 aa36.6■■■■□ 3.45
OPN3-204ENST00000469376 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.56■■■■□ 3.44
OPN3-204ENST00000469376 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.56■■■■□ 3.44
OPN3-204ENST00000469376 ASXL2Q76L83 1435 aa36.55■■■■□ 3.44
OPN3-204ENST00000469376 ANP32CO43423 234 aa36.51■■■■□ 3.43
OPN3-204ENST00000469376 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
OPN3-204ENST00000469376 MYT1Q01538 1121 aa36.47■■■■□ 3.43
OPN3-204ENST00000469376 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.46■■■■□ 3.432e-7■■□□□ 11.5
OPN3-204ENST00000469376 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
OPN3-204ENST00000469376 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.44■■■■□ 3.42
OPN3-204ENST00000469376 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.42■■■■□ 3.42
OPN3-204ENST00000469376 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.42■■■■□ 3.42
OPN3-204ENST00000469376 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.41■■■■□ 3.42
OPN3-204ENST00000469376 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.4■■■■□ 3.42
OPN3-204ENST00000469376 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.42
OPN3-204ENST00000469376 KDM6BO15054 1643 aa36.35■■■■□ 3.41
OPN3-204ENST00000469376 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.35■■■■□ 3.41
OPN3-204ENST00000469376 ROCK1Q13464 1354 aa36.32■■■■□ 3.41
OPN3-204ENST00000469376 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 PREX2Q70Z35 1606 aa36.31■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.29■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 TRIM52Q96A61 297 aa36.29■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.28■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.27■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 PLCH2O75038 1416 aa36.27■■■■□ 3.4
OPN3-204ENST00000469376 DAPK1P53355 1430 aa36.26■■■■□ 3.39
OPN3-204ENST00000469376 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.26■■■■□ 3.39
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.24■■■■□ 3.39
OPN3-204ENST00000469376 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.24■■■■□ 3.39
OPN3-204ENST00000469376 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.16■■■■□ 3.38
OPN3-204ENST00000469376 ABCC5O15440 1437 aa36.16■■■■□ 3.38
OPN3-204ENST00000469376 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.16■■■■□ 3.38
OPN3-204ENST00000469376 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.14■■■■□ 3.38
OPN3-204ENST00000469376 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.11■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 CD109Q6YHK3 1445 aa36.11■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 FKBP8Q14318 412 aa36.09■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 NEFLP07196 543 aa36.09■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.08■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 GLI2P10070 1586 aa36.08■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.07■■■■□ 3.37
OPN3-204ENST00000469376 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa36.07■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 DIP2BQ9P265 1576 aa36.05■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 FANCAO15360 1455 aa36.05■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.05■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.04■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.04■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 MBD5Q9P267 1494 aa36.03■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.03■■■■□ 3.36
OPN3-204ENST00000469376 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 SYCP2Q9BX26 1530 aa36■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 TEX14Q8IWB6 1497 aa36■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF5Q12774 1597 aa36■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.99■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.99■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.98■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 ABCC1P33527 1531 aa35.96■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 NCOA1Q15788 1441 aa35.96■■■■□ 3.35
OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.95■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.94■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.93■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 TSPY4P0CV99 314 aa35.92■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 TSPY10P0CW01 314 aa35.92■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 FOXD1Q16676 465 aa35.92■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 ADGRL2O95490 1459 aa35.92■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 BCANQ96GW7 911 aa35.91■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.9■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.9■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 CCDC7Q96M83 1385 aa35.89■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
OPN3-204ENST00000469376 ADGRL1O94910 1474 aa35.88■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 PZPP20742 1482 aa35.88■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.86■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.85■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 NEO1Q92859 1461 aa35.84■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.84■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.84■■■■□ 3.33
OPN3-204ENST00000469376 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.82■■■■□ 3.32
OPN3-204ENST00000469376 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms