RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469325.5

VAV3-204, Transcript of vav guanine nucleotide exchange factor 3, human

TSL 2

Gene VAV3, Length 2,487 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VAV3-204	ENST00000469325	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		7.43	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		7.42	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	NAIP	Q13075	1403 aa		7.42	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		7.42	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		7.41	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	UACA	Q9BZF9	1416 aa		7.41	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
VAV3-204	ENST00000469325	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		7.4	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	TRIM52	Q96A61	297 aa		7.39	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	PTPRG	P23470	1445 aa		7.38	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	DSG3	P32926	999 aa		7.38	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	MIER1	Q8N108	512 aa		7.38	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	AKNA	Q7Z591	1439 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	CHD1	O14646	1710 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	TONSL	Q96HA7	1378 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	DAPK1	P53355	1430 aa		7.37	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ATP10B	O94823	1461 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ABCA8	O94911	1581 aa		7.36	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		7.35	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ABCC5	O15440	1437 aa		7.35	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ROCK1	Q13464	1354 aa		7.35	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		7.35	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	KIF14	Q15058	1648 aa		7.34	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		7.34	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		7.34	□□□□□ -1.23
VAV3-204	ENST00000469325	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		7.34	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	CAPN15	O75808	1086 aa		7.33	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	KDM6B	O15054	1643 aa		7.32	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.31	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	NCOA1	Q15788	1441 aa		7.31	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	TSPY4	P0CV99	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	TSPY10	P0CW01	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		7.3	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		7.3	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		7.28	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	ADGRL2	O95490	1459 aa		7.28	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	ABCC2	Q92887	1545 aa		7.27	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		7.27	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	KCNH8	Q96L42	1107 aa		7.27	□□□□□ -1.24
VAV3-204	ENST00000469325	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		7.27	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		7.26	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		7.25	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	PREX2	Q70Z35	1606 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	PKD2	Q13563	968 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	NUP155	O75694	1391 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	KIF15	Q9NS87	1388 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	MBD5	Q9P267	1494 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	PZP	P20742	1482 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		7.24	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	7.23	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		7.23	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		7.22	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		7.21	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	ZBTB22	O15209	634 aa		7.21	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		7.21	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		7.21	□□□□□ -1.25
VAV3-204	ENST00000469325	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		7.21	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	ANP32C	O43423	234 aa		7.21	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	PLCH2	O75038	1416 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		7.2	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		7.19	□□□□□ -1.26
VAV3-204	ENST00000469325	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	7.18	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms