RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468923.5

NCBP2-211, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene NCBP2, Length 1,096 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2-211ENST00000468923 HSPA2P54652 639 aa23.12■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 MLECQ14165 292 aa23.11■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.1■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.1■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 RICTORQ6R327 1708 aa23.1■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.09■■□□□ 1.29
NCBP2-211ENST00000468923 KIF14Q15058 1648 aa23.06■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.05■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.05■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.04■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.04■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.03■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 TIAM1Q13009 1591 aa23.02■■□□□ 1.28
NCBP2-211ENST00000468923 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.01■■□□□ 1.27
NCBP2-211ENST00000468923 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.01■■□□□ 1.27
NCBP2-211ENST00000468923 PLCH2O75038 1416 aa23■■□□□ 1.27
NCBP2-211ENST00000468923 CERKQ8TCT0 537 aa22.98■■□□□ 1.27
NCBP2-211ENST00000468923 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.98■■□□□ 1.27
NCBP2-211ENST00000468923 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.96■■□□□ 1.27
NCBP2-211ENST00000468923 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.95■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 ATP10AO60312 1499 aa22.94■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 MAP3K1Q13233 1512 aa22.93■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.93■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.92■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.9■■□□□ 1.26
NCBP2-211ENST00000468923 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.89■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 PREX2Q70Z35 1606 aa22.89■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.88■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 AFAP1Q8N556 730 aa22.88■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.87■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.87■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.85■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.84■■□□□ 1.25
NCBP2-211ENST00000468923 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.82■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.82■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.81■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 NCOA2Q15596 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 APLP2Q06481 763 aa22.79■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.77■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.77■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NCBP2-211ENST00000468923 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.75■■□□□ 1.23
NCBP2-211ENST00000468923 KDM5CP41229 1560 aa22.72■■□□□ 1.23
NCBP2-211ENST00000468923 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
NCBP2-211ENST00000468923 ABCC1P33527 1531 aa22.71■■□□□ 1.23
NCBP2-211ENST00000468923 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.69■■□□□ 1.22
NCBP2-211ENST00000468923 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.67■■□□□ 1.22
NCBP2-211ENST00000468923 STRCQ7RTU9 1775 aa22.67■■□□□ 1.22
NCBP2-211ENST00000468923 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.66■■□□□ 1.22
NCBP2-211ENST00000468923 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.66■■□□□ 1.22
NCBP2-211ENST00000468923 REREQ9P2R6 1566 aa22.64■■□□□ 1.22
NCBP2-211ENST00000468923 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.63■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 PTPRTO14522 1441 aa22.63■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.62■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 AGLP35573 1532 aa22.62■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 ABCA6Q8N139 1617 aa22.61■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 C3P01024 1663 aa22.6■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.6■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.59■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.58■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 ILDR2Q71H61 639 aa22.58■■□□□ 1.21
NCBP2-211ENST00000468923 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 MIA2Q96PC5 1412 aa22.55■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.55■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.53■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.53■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 ZMYM3Q14202 1370 aa22.53■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 SOCS7O14512 581 aa22.52■■□□□ 1.2
NCBP2-211ENST00000468923 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.51■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 NCOA1Q15788 1441 aa22.5■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 MBD5Q9P267 1494 aa22.5■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.49■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.48■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 NPATQ14207 1427 aa22.48■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.47■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 GGT6Q6P531 493 aa22.47■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.47■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.46■■□□□ 1.19
NCBP2-211ENST00000468923 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.44■■□□□ 1.18
NCBP2-211ENST00000468923 ATP7AQ04656 1500 aa22.44■■□□□ 1.18
NCBP2-211ENST00000468923 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.44■■□□□ 1.18
NCBP2-211ENST00000468923 PKD2Q13563 968 aa22.42■■□□□ 1.18
NCBP2-211ENST00000468923 MROH2AA6NES4 1674 aa22.42■■□□□ 1.18
NCBP2-211ENST00000468923 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
NCBP2-211ENST00000468923 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.9 ms