RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468031.1

NME4-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,861 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-210ENST00000468031 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.19■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.16■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 KDM6BO15054 1643 aa27.15■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.15■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 NEUROD1Q13562 356 aa27.14■■□□□ 1.94
NME4-210ENST00000468031 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-210ENST00000468031 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.12■■□□□ 1.93
NME4-210ENST00000468031 ADGRL2O95490 1459 aa27.09■■□□□ 1.93
NME4-210ENST00000468031 ABCC2Q92887 1545 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.07■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 TONSLQ96HA7 1378 aa27.04■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 NCOA1Q15788 1441 aa27.03■■□□□ 1.92
NME4-210ENST00000468031 TRIM52Q96A61 297 aa27■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 PREX2Q70Z35 1606 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 MIER1Q8N108 512 aa26.98■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.97■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.96■■□□□ 1.91
NME4-210ENST00000468031 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.93■■□□□ 1.9
NME4-210ENST00000468031 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.93■■□□□ 1.9
NME4-210ENST00000468031 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.9■■□□□ 1.9
NME4-210ENST00000468031 MBD5Q9P267 1494 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.88■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.891e-8■□□□□ 9.6
NME4-210ENST00000468031 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.87■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.85■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 PZPP20742 1482 aa26.85■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.84■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.83■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.83■■□□□ 1.89
NME4-210ENST00000468031 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.82■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 TSPY4P0CV99 314 aa26.81■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 TSPY10P0CW01 314 aa26.81■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.78■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.77■■□□□ 1.88
NME4-210ENST00000468031 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.76■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.75■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 KIF15Q9NS87 1388 aa26.73■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 FOXD1Q16676 465 aa26.72■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 PLCH2O75038 1416 aa26.7■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.7■■□□□ 1.87
NME4-210ENST00000468031 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-210ENST00000468031 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.66■■□□□ 1.86
NME4-210ENST00000468031 PLXNC1O60486 1568 aa26.65■■□□□ 1.86
NME4-210ENST00000468031 OSCARQ8IYS5 282 aa26.64■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 KCNH8Q96L42 1107 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 NUP155O75694 1391 aa26.63■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 PKD2Q13563 968 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 ABCC1P33527 1531 aa26.6■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.59■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.59■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.58■■□□□ 1.85
NME4-210ENST00000468031 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
NME4-210ENST00000468031 UNC13BO14795 1591 aa26.57■■□□□ 1.84
NME4-210ENST00000468031 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NME4-210ENST00000468031 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.53■■□□□ 1.84
NME4-210ENST00000468031 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.52■■□□□ 1.84
NME4-210ENST00000468031 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.51■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 ERBINQ96RT1 1412 aa26.49■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.47■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.46■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.45■■□□□ 1.83
NME4-210ENST00000468031 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-210ENST00000468031 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.44■■□□□ 1.82
NME4-210ENST00000468031 ASXL2Q76L83 1435 aa26.42■■□□□ 1.82
NME4-210ENST00000468031 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.41■■□□□ 1.82
NME4-210ENST00000468031 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.39■■□□□ 1.82
NME4-210ENST00000468031 FANCAO15360 1455 aa26.39■■□□□ 1.82
NME4-210ENST00000468031 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.39■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.36■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 ANP32CO43423 234 aa26.36■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 CCER2I3L3R5 266 aa26.35■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
NME4-210ENST00000468031 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.32■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 ATP10AO60312 1499 aa26.32■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.31■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.3■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 ADGRL1O94910 1474 aa26.29■■□□□ 1.8
NME4-210ENST00000468031 ATP7AQ04656 1500 aa26.29■■□□□ 1.8
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