RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 KIF14Q15058 1648 aa16.4■□□□□ 0.22
HPS1-208ENST00000467246 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.22
HPS1-208ENST00000467246 ABCA8O94911 1581 aa16.39■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 ATP10BO94823 1461 aa16.37■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 ROCK1Q13464 1354 aa16.37■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.37■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.37■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.35■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 PTPRGP23470 1445 aa16.35■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 FOXD1Q16676 465 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 CHD1O14646 1710 aa16.34■□□□□ 0.21
HPS1-208ENST00000467246 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.32■□□□□ 0.2
HPS1-208ENST00000467246 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
HPS1-208ENST00000467246 KDM5BQ9UGL1 1544 aa16.3■□□□□ 0.2
HPS1-208ENST00000467246 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.29■□□□□ 0.2
HPS1-208ENST00000467246 NCOA1Q15788 1441 aa16.28■□□□□ 0.2
HPS1-208ENST00000467246 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 SHROOM2Q13796 1616 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 ADGRL2O95490 1459 aa16.22■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 L3MBTL2Q969R5 705 aa16.22■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.22■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 KCNH8Q96L42 1107 aa16.21■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 CROCC2H7BZ55 1655 aa16.21■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.21■□□□□ 0.19
HPS1-208ENST00000467246 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.2■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 PZPP20742 1482 aa16.2■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.17■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 TSPY4P0CV99 314 aa16.17■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 TSPY10P0CW01 314 aa16.17■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 MBD5Q9P267 1494 aa16.14■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.14■□□□□ 0.18
HPS1-208ENST00000467246 ABCC2Q92887 1545 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 PKD2Q13563 968 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 NBPF8Q3BBV2 869 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 TEX14Q8IWB6 1497 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.11■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 PREX2Q70Z35 1606 aa16.11■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 NUP155O75694 1391 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 KIF15Q9NS87 1388 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.1■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 ANP32CO43423 234 aa16.09■□□□□ 0.17
HPS1-208ENST00000467246 MYT1Q01538 1121 aa16.08■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.08■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.08■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.07■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.06■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.05■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 CCER2I3L3R5 266 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-208ENST00000467246 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 PLCH2O75038 1416 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 CCDC7Q96M83 1385 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.96■□□□□ 0.15
HPS1-208ENST00000467246 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.95■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.93■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.92■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.91■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 PLXNC1O60486 1568 aa15.9■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 USP47Q96K76 1375 aa15.9■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.9■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.9■□□□□ 0.14
HPS1-208ENST00000467246 ABCC1P33527 1531 aa15.89■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 UNC13BO14795 1591 aa15.89■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 AFAP1Q8N556 730 aa15.88■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.88■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.87■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 PLA2R1Q13018 1463 aa15.87■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.86■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.86■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.85■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 ERBINQ96RT1 1412 aa15.85■□□□□ 0.13
HPS1-208ENST00000467246 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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