RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 KCNJ4P48050 445 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRN-211ENST00000462351 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.35■□□□□ 0.53
PTPRN-211ENST00000462351 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
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PTPRN-211ENST00000462351 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRN-211ENST00000462351 CDCA8Q53HL2 280 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRN-211ENST00000462351 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa18.34■□□□□ 0.53
PTPRN-211ENST00000462351 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.34■□□□□ 0.53
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PTPRN-211ENST00000462351 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRN-211ENST00000462351 CFTRP13569 1480 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRN-211ENST00000462351 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.07■□□□□ 0.48
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PTPRN-211ENST00000462351 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
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PTPRN-211ENST00000462351 TMF1P82094 1093 aa18.04■□□□□ 0.48
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PTPRN-211ENST00000462351 ARAP1Q96P48 1450 aa18.02■□□□□ 0.48
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PTPRN-211ENST00000462351 NUP155O75694 1391 aa18.01■□□□□ 0.47
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PTPRN-211ENST00000462351 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 TEX35Q5T0J7 233 aa18■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 GOLGA2Q08379 1002 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 JPH4Q96JJ6 628 aa17.99■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.98■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 PLEKHG5O94827 1062 aa17.97■□□□□ 0.47
PTPRN-211ENST00000462351 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
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PTPRN-211ENST00000462351 GGT6Q6P531 493 aa17.95■□□□□ 0.46
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