RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445482.2

VGF-202, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VGF, Length 2,477 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-202ENST00000445482 ANP32CO43423 234 aa30.06■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.04■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 CEP170Q5SW79 1584 aa30.02■■■□□ 2.4
VGF-202ENST00000445482 AKNAQ7Z591 1439 aa30.01■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 DAPK1P53355 1430 aa30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 PLB1Q6P1J6 1458 aa30■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 SYNJ2O15056 1496 aa29.98■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 ABCC5O15440 1437 aa29.96■■■□□ 2.39
VGF-202ENST00000445482 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 JPH4Q96JJ6 628 aa29.94■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
VGF-202ENST00000445482 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.88■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 ROCK1Q13464 1354 aa29.86■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.84■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 KIF14Q15058 1648 aa29.83■■■□□ 2.37
VGF-202ENST00000445482 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.82■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 NUP160Q12769 1436 aa29.8■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.77■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.76■■■□□ 2.36
VGF-202ENST00000445482 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.73■■■□□ 2.35
VGF-202ENST00000445482 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.71■■■□□ 2.35
VGF-202ENST00000445482 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.7■■■□□ 2.35
VGF-202ENST00000445482 NCOA1Q15788 1441 aa29.7■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.66■■■□□ 2.34
VGF-202ENST00000445482 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ATP10BO94823 1461 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 PZPP20742 1482 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.63■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ABCA8O94911 1581 aa29.62■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.59■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.58■■■□□ 2.33
VGF-202ENST00000445482 PKD2Q13563 968 aa29.57■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.57■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ADGRL2O95490 1459 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 MSH5O43196 834 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.54■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.53■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 PTPRGP23470 1445 aa29.52■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.51■■■□□ 2.32
VGF-202ENST00000445482 CCDC7Q96M83 1385 aa29.51■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.5■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.5■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 TSPY4P0CV99 314 aa29.49■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 TSPY10P0CW01 314 aa29.49■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.49■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 NUP155O75694 1391 aa29.46■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 CCDC184Q52MB2 194 aa29.46■■■□□ 2.31
VGF-202ENST00000445482 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.44■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.43■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.41■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.4■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 CHD1O14646 1710 aa29.4■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.39■■■□□ 2.3
VGF-202ENST00000445482 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 KIF15Q9NS87 1388 aa29.37■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.36■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.35■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.33■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 MBD5Q9P267 1494 aa29.33■■■□□ 2.29
VGF-202ENST00000445482 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 USP47Q96K76 1375 aa29.31■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 MRS2Q9HD23 443 aa29.3■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.3■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.29■■■□□ 2.28
VGF-202ENST00000445482 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.25■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.25■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.24■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 PREX2Q70Z35 1606 aa29.24■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.22■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.21■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.2■■■□□ 2.27
VGF-202ENST00000445482 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.2■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.2■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.19■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.18■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 KDM5CP41229 1560 aa29.16■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
VGF-202ENST00000445482 SHROOM2Q13796 1616 aa29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms