RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 NUP160Q12769 1436 aa22.65■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.64■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
SHQ1-202ENST00000444040 CCER2I3L3R5 266 aa22.64■■□□□ 1.21
SHQ1-202ENST00000444040 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SHQ1-202ENST00000444040 ANP32CO43423 234 aa22.61■■□□□ 1.21
SHQ1-202ENST00000444040 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.59■■□□□ 1.21
SHQ1-202ENST00000444040 JPH4Q96JJ6 628 aa22.58■■□□□ 1.21
SHQ1-202ENST00000444040 FBLN2P98095 1184 aa22.58■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 FOXD1Q16676 465 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.57■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.56■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.55■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 KIF14Q15058 1648 aa22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SHQ1-202ENST00000444040 NCOA1Q15788 1441 aa22.5■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 ABCA8O94911 1581 aa22.49■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 ADGRL2O95490 1459 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 PZPP20742 1482 aa22.47■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.46■■□□□ 1.19
SHQ1-202ENST00000444040 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.45■■□□□ 1.18
SHQ1-202ENST00000444040 ATP10BO94823 1461 aa22.44■■□□□ 1.18
SHQ1-202ENST00000444040 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SHQ1-202ENST00000444040 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.42■■□□□ 1.18
SHQ1-202ENST00000444040 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.41■■□□□ 1.18
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC7Q96M83 1385 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-202ENST00000444040 MBD5Q9P267 1494 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-202ENST00000444040 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.3■■□□□ 1.16
SHQ1-202ENST00000444040 PTPRGP23470 1445 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-202ENST00000444040 PKD2Q13563 968 aa22.29■■□□□ 1.16
SHQ1-202ENST00000444040 FKBP8Q14318 412 aa22.28■■□□□ 1.16
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.24■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 TSPY4P0CV99 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 TSPY10P0CW01 314 aa22.23■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 NUP155O75694 1391 aa22.22■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
SHQ1-202ENST00000444040 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 BCANQ96GW7 911 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 KIF15Q9NS87 1388 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC184Q52MB2 194 aa22.19■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 CHD1O14646 1710 aa22.18■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 PREX2Q70Z35 1606 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 NEFLP07196 543 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 SHROOM2Q13796 1616 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.17■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.16■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 USP47Q96K76 1375 aa22.14■■□□□ 1.14
SHQ1-202ENST00000444040 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-202ENST00000444040 KDM5CP41229 1560 aa22.12■■□□□ 1.13
SHQ1-202ENST00000444040 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.11■■□□□ 1.13
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-202ENST00000444040 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.1■■□□□ 1.13
SHQ1-202ENST00000444040 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.08■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 MRS2Q9HD23 443 aa22.07■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.06■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.06■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 ABCC2Q92887 1545 aa22.06■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.06■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.05■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.03■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.02■■□□□ 1.12
SHQ1-202ENST00000444040 CARD11Q9BXL7 1154 aa22■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 UNC13BO14795 1591 aa21.99■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.98■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.97■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 PLXNC1O60486 1568 aa21.96■■□□□ 1.11
SHQ1-202ENST00000444040 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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