RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442720.5

SGO1-209, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 2,266 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-209ENST00000442720 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
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SGO1-209ENST00000442720 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.55■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.52■■■□□ 2
SGO1-209ENST00000442720 ITSN2Q9NZM3 1697 aa27.52■■■□□ 2
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SGO1-209ENST00000442720 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.5■■□□□ 1.99
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SGO1-209ENST00000442720 ATP10BO94823 1461 aa27.4■■□□□ 1.98
SGO1-209ENST00000442720 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.38■■□□□ 1.97
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SGO1-209ENST00000442720 KCNH8Q96L42 1107 aa27.36■■□□□ 1.97
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SGO1-209ENST00000442720 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.35■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 ADGRL2O95490 1459 aa27.33■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.33■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SGO1-209ENST00000442720 PTPRGP23470 1445 aa27.32■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.32■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa27.31■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 ANP32CO43423 234 aa27.31■■□□□ 1.96
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SGO1-209ENST00000442720 CHD1O14646 1710 aa27.28■■□□□ 1.96
SGO1-209ENST00000442720 CCER2I3L3R5 266 aa27.28■■□□□ 1.96
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SGO1-209ENST00000442720 PZPP20742 1482 aa27.25■■□□□ 1.95
SGO1-209ENST00000442720 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
SGO1-209ENST00000442720 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.2■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.18■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.17■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 SHROOM2Q13796 1616 aa27.17■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 TSPY4P0CV99 314 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 TSPY10P0CW01 314 aa27.15■■□□□ 1.94
SGO1-209ENST00000442720 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.13■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.13■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.11■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 PKD2Q13563 968 aa27.1■■□□□ 1.93
SGO1-209ENST00000442720 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.07■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 MBD5Q9P267 1494 aa27.06■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 PREX2Q70Z35 1606 aa27.06■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.04■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 NUP155O75694 1391 aa27.04■■□□□ 1.92
SGO1-209ENST00000442720 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
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SGO1-209ENST00000442720 KIF15Q9NS87 1388 aa27.01■■□□□ 1.91
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SGO1-209ENST00000442720 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.01■■□□□ 1.91
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SGO1-209ENST00000442720 CCDC7Q96M83 1385 aa27■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.98■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.98■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.91
SGO1-209ENST00000442720 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.94■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.93■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.9■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.89■■□□□ 1.9
SGO1-209ENST00000442720 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.89■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.88■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.86■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.86■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.85■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.84■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.83■■□□□ 1.89
SGO1-209ENST00000442720 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.82■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 USP47Q96K76 1375 aa26.81■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 PLCH2O75038 1416 aa26.78■■□□□ 1.88
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SGO1-209ENST00000442720 PLXNC1O60486 1568 aa26.77■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 KDM5CP41229 1560 aa26.77■■□□□ 1.88
SGO1-209ENST00000442720 UNC13BO14795 1591 aa26.76■■□□□ 1.87
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SGO1-209ENST00000442720 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.74■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 FKBP8Q14318 412 aa26.73■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.73■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.72■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.71■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.7■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.7■■□□□ 1.87
SGO1-209ENST00000442720 NEFLP07196 543 aa26.69■■□□□ 1.86
SGO1-209ENST00000442720 CCDC184Q52MB2 194 aa26.69■■□□□ 1.86
SGO1-209ENST00000442720 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.861e-8■■■■■ 27.4
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