RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439969.2

C6orf223-202, Transcript of chromosome 6 open reading frame 223, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C6orf223, Length 2,757 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223-202ENST00000439969 ABCC5O15440 1437 aa26.78■■□□□ 1.88
C6orf223-202ENST00000439969 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
C6orf223-202ENST00000439969 NUP160Q12769 1436 aa26.75■■□□□ 1.87
C6orf223-202ENST00000439969 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.75■■□□□ 1.87
C6orf223-202ENST00000439969 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
C6orf223-202ENST00000439969 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
C6orf223-202ENST00000439969 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.7■■□□□ 1.86
C6orf223-202ENST00000439969 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.67■■□□□ 1.86
C6orf223-202ENST00000439969 AKNAQ7Z591 1439 aa26.67■■□□□ 1.86
C6orf223-202ENST00000439969 KIF14Q15058 1648 aa26.66■■□□□ 1.86
C6orf223-202ENST00000439969 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
C6orf223-202ENST00000439969 ANP32CO43423 234 aa26.63■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.63■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 ROCK1Q13464 1354 aa26.62■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 ATP10BO94823 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.59■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 PTPRGP23470 1445 aa26.59■■□□□ 1.85
C6orf223-202ENST00000439969 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.57■■□□□ 1.84
C6orf223-202ENST00000439969 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.54■■□□□ 1.84
C6orf223-202ENST00000439969 NCOA1Q15788 1441 aa26.54■■□□□ 1.84
C6orf223-202ENST00000439969 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.53■■□□□ 1.84
C6orf223-202ENST00000439969 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.52■■□□□ 1.84
C6orf223-202ENST00000439969 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
C6orf223-202ENST00000439969 PKD2Q13563 968 aa26.5■■□□□ 1.83
C6orf223-202ENST00000439969 ABCA8O94911 1581 aa26.49■■□□□ 1.83
C6orf223-202ENST00000439969 TSPY4P0CV99 314 aa26.49■■□□□ 1.83
C6orf223-202ENST00000439969 TSPY10P0CW01 314 aa26.49■■□□□ 1.83
C6orf223-202ENST00000439969 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.48■■□□□ 1.83
C6orf223-202ENST00000439969 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.48■■□□□ 1.83
C6orf223-202ENST00000439969 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.44■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.42■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 PZPP20742 1482 aa26.42■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.4■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 NUP155O75694 1391 aa26.4■■□□□ 1.82
C6orf223-202ENST00000439969 CCER2I3L3R5 266 aa26.39■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.38■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.38■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 CHD1O14646 1710 aa26.38■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.36■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.36■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.33■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
C6orf223-202ENST00000439969 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.32■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.32■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 ADGRL2O95490 1459 aa26.31■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa26.31■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 KIF15Q9NS87 1388 aa26.31■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 BCANQ96GW7 911 aa26.3■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 ADGBQ8N7X0 1667 aa26.28■■□□□ 1.8
C6orf223-202ENST00000439969 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.24■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 CCDC7Q96M83 1385 aa26.24■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 CCDC184Q52MB2 194 aa26.24■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 MBD5Q9P267 1494 aa26.22■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 FKBP8Q14318 412 aa26.21■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.2■■□□□ 1.79
C6orf223-202ENST00000439969 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.18■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.18■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.17■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 RGL3Q3MIN7 710 aa26.16■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.16■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.16■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.15■■□□□ 1.78
C6orf223-202ENST00000439969 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.14■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.13■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.13■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.13■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.12■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 USP47Q96K76 1375 aa26.12■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.12■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.11■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 ABCC2Q92887 1545 aa26.09■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 SHROOM2Q13796 1616 aa26.09■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 MRS2Q9HD23 443 aa26.08■■□□□ 1.77
C6orf223-202ENST00000439969 PREX2Q70Z35 1606 aa26.07■■□□□ 1.76
C6orf223-202ENST00000439969 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.05■■□□□ 1.76
C6orf223-202ENST00000439969 NEFLP07196 543 aa26.05■■□□□ 1.76
C6orf223-202ENST00000439969 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.03■■□□□ 1.76
C6orf223-202ENST00000439969 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.01■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.01■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 AFAP1Q8N556 730 aa26■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.99■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.99■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.99■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C6orf223-202ENST00000439969 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.95■■□□□ 1.74
C6orf223-202ENST00000439969 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.93■■□□□ 1.74
C6orf223-202ENST00000439969 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.93■■□□□ 1.74
C6orf223-202ENST00000439969 PLCH2O75038 1416 aa25.93■■□□□ 1.74
C6orf223-202ENST00000439969 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
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