RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439893.1

LINC01886-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1886, humanhuman

TSL 4

Gene LINC01886, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01886-201ENST00000439893 ST18O60284 1047 aa9.21□□□□□ -0.94
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LINC01886-201ENST00000439893 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.14□□□□□ -0.95
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LINC01886-201ENST00000439893 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 DSG2Q14126 1118 aa8.7□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 FOXK1P85037 733 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.69□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 ERBB3P21860 1342 aa8.67□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.67□□□□□ -1.02
LINC01886-201ENST00000439893 C2orf72A6NCS6 295 aa8.66□□□□□ -1.02
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