RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439806.6

CPNE1-218, Transcript of copine 1, humanhuman

TSL 5

Gene CPNE1, Length 748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1-218ENST00000439806 TRIM52Q96A61 297 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 ROCK1Q13464 1354 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.95□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 ABCC5O15440 1437 aa14.92□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.92□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CPNE1-218ENST00000439806 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 SHROOM2Q13796 1616 aa14.88□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.88□□□□□ -0.03
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CPNE1-218ENST00000439806 ATP10BO94823 1461 aa14.88□□□□□ -0.03
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CPNE1-218ENST00000439806 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.85□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 ADGRL2O95490 1459 aa14.84□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CPNE1-218ENST00000439806 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.82□□□□□ -0.04
CPNE1-218ENST00000439806 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.81□□□□□ -0.04
CPNE1-218ENST00000439806 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.81□□□□□ -0.04
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CPNE1-218ENST00000439806 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.78□□□□□ -0.04
CPNE1-218ENST00000439806 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.78□□□□□ -0.04
CPNE1-218ENST00000439806 NCOA1Q15788 1441 aa14.78□□□□□ -0.04
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CPNE1-218ENST00000439806 ABCC2Q92887 1545 aa14.76□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.75□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.75□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.74□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.73□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 TSPY4P0CV99 314 aa14.71□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.71□□□□□ -0.05
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CPNE1-218ENST00000439806 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.7□□□□□ -0.06
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CPNE1-218ENST00000439806 MBD5Q9P267 1494 aa14.66□□□□□ -0.06
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CPNE1-218ENST00000439806 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.66□□□□□ -0.06
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CPNE1-218ENST00000439806 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.65□□□□□ -0.06
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CPNE1-218ENST00000439806 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.47□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.093e-9■□□□□ 9.4
CPNE1-218ENST00000439806 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.46□□□□□ -0.09
CPNE1-218ENST00000439806 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CPNE1-218ENST00000439806 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.44□□□□□ -0.1
CPNE1-218ENST00000439806 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.44□□□□□ -0.1
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