RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.97■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.95■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 C14orf37Q86TY3 774 aa20.93■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 RALBP1Q15311 655 aa20.93■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 NESP48681 1621 aa20.93■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.92■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
C9orf172-201ENST00000436881 PTPRGP23470 1445 aa20.91■□□□□ 0.94
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C9orf172-201ENST00000436881 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.89■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.88■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 MLECQ14165 292 aa20.88■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.88■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 PRXQ9BXM0 1461 aa20.88■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.88■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 MORC1Q86VD1 984 aa20.87■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 HMGXB3Q12766 1538 aa20.87■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 BECN1Q14457 450 aa20.86■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.85■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.84■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 MS4A1P11836 297 aa20.83■□□□□ 0.93
C9orf172-201ENST00000436881 TOP2BQ02880 1626 aa20.82■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.82■□□□□ 0.92
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C9orf172-201ENST00000436881 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 CUX1P39880 1505 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 NLRP13Q86W25 1043 aa20.79■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHG5O94827 1062 aa20.78■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 RGS3P49796 1198 aa20.77■□□□□ 0.92
C9orf172-201ENST00000436881 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.76■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.76■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 STK26Q9P289 416 aa20.76■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 UACAQ9BZF9 1416 aa20.76■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 WDR97A6NE52 1622 aa20.75■□□□□ 0.91
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C9orf172-201ENST00000436881 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.74■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.72■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.72■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 NCOA2Q15596 1464 aa20.71■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
C9orf172-201ENST00000436881 TOPBP1Q92547 1522 aa20.69■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 KIF15Q9NS87 1388 aa20.68■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 PDE3BQ13370 1112 aa20.68■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 USP47Q96K76 1375 aa20.67■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.66■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
C9orf172-201ENST00000436881 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.64■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.63■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.62■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.62■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 CASC1Q6TDU7 716 aa20.61■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 TERF2IPQ9NYB0 399 aa20.61■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA2Q08379 1002 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 TIAM1Q13009 1591 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 ARXQ96QS3 562 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 PANK3Q9H999 370 aa20.6■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.59■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
C9orf172-201ENST00000436881 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.57■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.57■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 SOX12O15370 315 aa20.57■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 A0A0G2JS52 829 aa20.56■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 MSH5O43196 834 aa20.56■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 STAC3Q96MF2 364 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 IFT140Q96RY7 1462 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.55■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
C9orf172-201ENST00000436881 MIA2Q96PC5 1412 aa20.53■□□□□ 0.88
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