RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

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Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.6■■■□□ 2.17
NICN1-204ENST00000436744 PLCH2O75038 1416 aa28.6■■■□□ 2.17
NICN1-204ENST00000436744 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.57■■■□□ 2.16
NICN1-204ENST00000436744 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.56■■■□□ 2.16
NICN1-204ENST00000436744 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
NICN1-204ENST00000436744 KIF14Q15058 1648 aa28.54■■■□□ 2.16
NICN1-204ENST00000436744 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.53■■■□□ 2.16
NICN1-204ENST00000436744 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.52■■■□□ 2.16
NICN1-204ENST00000436744 FMN1Q68DA7 1419 aa28.49■■■□□ 2.15
NICN1-204ENST00000436744 ATP10AO60312 1499 aa28.47■■■□□ 2.15
NICN1-204ENST00000436744 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.46■■■□□ 2.15
NICN1-204ENST00000436744 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.46■■■□□ 2.15
NICN1-204ENST00000436744 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.45■■■□□ 2.15
NICN1-204ENST00000436744 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.44■■■□□ 2.14
NICN1-204ENST00000436744 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
NICN1-204ENST00000436744 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.42■■■□□ 2.14
NICN1-204ENST00000436744 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
NICN1-204ENST00000436744 AFAP1Q8N556 730 aa28.4■■■□□ 2.14
NICN1-204ENST00000436744 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
NICN1-204ENST00000436744 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.37■■■□□ 2.13
NICN1-204ENST00000436744 KDM5CP41229 1560 aa28.36■■■□□ 2.13
NICN1-204ENST00000436744 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.35■■■□□ 2.13
NICN1-204ENST00000436744 CERKQ8TCT0 537 aa28.35■■■□□ 2.13
NICN1-204ENST00000436744 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.35■■■□□ 2.13
NICN1-204ENST00000436744 CLIP1P30622 1438 aa28.33■■■□□ 2.13
NICN1-204ENST00000436744 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.33■■■□□ 2.12
NICN1-204ENST00000436744 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.32■■■□□ 2.12
NICN1-204ENST00000436744 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.31■■■□□ 2.12
NICN1-204ENST00000436744 ABCA6Q8N139 1617 aa28.3■■■□□ 2.12
NICN1-204ENST00000436744 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.26■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 STRCQ7RTU9 1775 aa28.25■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 PREX2Q70Z35 1606 aa28.25■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 ABCC1P33527 1531 aa28.23■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.22■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.21■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.21■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 REREQ9P2R6 1566 aa28.2■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 C3P01024 1663 aa28.2■■■□□ 2.11
NICN1-204ENST00000436744 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.18■■■□□ 2.1
NICN1-204ENST00000436744 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.16■■■□□ 2.1
NICN1-204ENST00000436744 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.15■■■□□ 2.1
NICN1-204ENST00000436744 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.15■■■□□ 2.1
NICN1-204ENST00000436744 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
NICN1-204ENST00000436744 AGLP35573 1532 aa28.13■■■□□ 2.09
NICN1-204ENST00000436744 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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NICN1-204ENST00000436744 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.09■■■□□ 2.09
NICN1-204ENST00000436744 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.07■■■□□ 2.08
NICN1-204ENST00000436744 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.05■■■□□ 2.08
NICN1-204ENST00000436744 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.04■■■□□ 2.08
NICN1-204ENST00000436744 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 PTPRTO14522 1441 aa28.01■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.98■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 NCOA1Q15788 1441 aa27.97■■■□□ 2.07
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NICN1-204ENST00000436744 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.96■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.96■■■□□ 2.07
NICN1-204ENST00000436744 ILDR2Q71H61 639 aa27.94■■■□□ 2.06
NICN1-204ENST00000436744 ZMYM3Q14202 1370 aa27.93■■■□□ 2.06
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NICN1-204ENST00000436744 ATP7AQ04656 1500 aa27.92■■■□□ 2.06
NICN1-204ENST00000436744 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.92■■■□□ 2.06
NICN1-204ENST00000436744 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
NICN1-204ENST00000436744 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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NICN1-204ENST00000436744 CCNB3Q8WWL7 1395 aa27.86■■■□□ 2.05
NICN1-204ENST00000436744 A2MP01023 1474 aa27.86■■■□□ 2.05
NICN1-204ENST00000436744 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa27.85■■■□□ 2.05
NICN1-204ENST00000436744 GGT6Q6P531 493 aa27.84■■■□□ 2.05
NICN1-204ENST00000436744 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
NICN1-204ENST00000436744 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.84■■■□□ 2.05
NICN1-204ENST00000436744 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.82■■■□□ 2.04
NICN1-204ENST00000436744 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.82■■■□□ 2.04
NICN1-204ENST00000436744 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
NICN1-204ENST00000436744 PTPRKQ15262 1439 aa27.8■■■□□ 2.04
NICN1-204ENST00000436744 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.8■■■□□ 2.04
NICN1-204ENST00000436744 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
NICN1-204ENST00000436744 TIAM1Q13009 1591 aa27.78■■■□□ 2.04
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NICN1-204ENST00000436744 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.75■■■□□ 2.03
NICN1-204ENST00000436744 MBD5Q9P267 1494 aa27.72■■■□□ 2.03
NICN1-204ENST00000436744 PLA2R1Q13018 1463 aa27.7■■■□□ 2.03
NICN1-204ENST00000436744 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
NICN1-204ENST00000436744 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.7■■■□□ 2.02
NICN1-204ENST00000436744 SOCS7O14512 581 aa27.69■■■□□ 2.02
NICN1-204ENST00000436744 UBAP1LF5GYI3 381 aa27.67■■■□□ 2.02
NICN1-204ENST00000436744 PKD2Q13563 968 aa27.66■■■□□ 2.02
NICN1-204ENST00000436744 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.63■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 CEP162Q5TB80 1403 aa27.63■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.62■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
NICN1-204ENST00000436744 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.6■■■□□ 2.01
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