RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGF1RP08069 1367 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UGGT2Q9NYU1 1516 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCA8O94911 1581 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALKQ9UM73 1620 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C3P01024 1663 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTEDQ86YR6 584 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRKQ15262 1439 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPS1P31327 1500 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFFO2Q5TF58 517 aa16■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HECW1Q76N89 1606 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKD2Q13563 968 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP10AO60312 1499 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLA2R1Q13018 1463 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.95■□□□□ 0.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF27Q86VH2 1401 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP10BO94823 1461 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.92■□□□□ 0.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.9■□□□□ 0.14
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPATQ14207 1427 aa15.87■□□□□ 0.13
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GOLGA3Q08378 1498 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARID3CA6NKF2 412 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGLP35573 1532 aa15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 REREQ9P2R6 1566 aa15.79■□□□□ 0.12
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.77■□□□□ 0.12
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.77■□□□□ 0.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MROH2AA6NES4 1674 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.75■□□□□ 0.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.74■□□□□ 0.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM52Q96A61 297 aa15.73■□□□□ 0.11
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.73■□□□□ 0.11
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZMYM3Q14202 1370 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM5CP41229 1560 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCA6Q8N139 1617 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RXRBP28702 533 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRP5O75197 1615 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLCH2O75038 1416 aa15.57■□□□□ 0.08
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MED14O60244 1454 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.53■□□□□ 0.08
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PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JCADQ9P266 1359 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEPDC5O75140 1603 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFAP1Q8N556 730 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRP6O75581 1613 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IQGAP1P46940 1657 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGS12O14924 1447 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YY1P25490 414 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHLPP1O60346 1717 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCC1P33527 1531 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.41■□□□□ 0.06
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