RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCC5O15440 1437 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KCNH8Q96L42 1107 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.11■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP10BO94823 1461 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PTPRGP23470 1445 aa18.04■□□□□ 0.48
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHD1O14646 1710 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AKNAQ7Z591 1439 aa18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCA8O94911 1581 aa18.02■□□□□ 0.47
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ROCK1Q13464 1354 aa17.99■□□□□ 0.47
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KDM5BQ9UGL1 1544 aa17.98■□□□□ 0.47
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ITSN2Q9NZM3 1697 aa17.95■□□□□ 0.46
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADCY10Q96PN6 1610 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.91■□□□□ 0.46
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.89■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TSPY10P0CW01 314 aa17.88■□□□□ 0.45
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PZPP20742 1482 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C9orf84Q5VXU9 1444 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANP32CO43423 234 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NUP155O75694 1391 aa17.83■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.83■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ADGRL2O95490 1459 aa17.82■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SHROOM2Q13796 1616 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF15Q9NS87 1388 aa17.8■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEX14Q8IWB6 1497 aa17.79■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.78■□□□□ 0.44
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MBD5Q9P267 1494 aa17.78■□□□□ 0.44
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.77■□□□□ 0.43
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCC2Q92887 1545 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.75■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa17.73■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PREX2Q70Z35 1606 aa17.73■□□□□ 0.43
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SHANK2Q9UPX8 1470 aa17.72■□□□□ 0.43
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.69■□□□□ 0.42
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCER2I3L3R5 266 aa17.68■□□□□ 0.42
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ARHGEF5Q12774 1597 aa17.68■□□□□ 0.42
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIF7Q2M1P5 1343 aa17.64■□□□□ 0.41
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC184Q52MB2 194 aa17.64■□□□□ 0.41
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 AFAP1Q8N556 730 aa17.62■□□□□ 0.41
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.61■□□□□ 0.41
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP47Q96K76 1375 aa17.6■□□□□ 0.41
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLCH2O75038 1416 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.59■□□□□ 0.41
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCANQ96GW7 911 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.58■□□□□ 0.41
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYT1LQ9UL68 1186 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.57■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM9BQ8IZU0 186 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.53■□□□□ 0.4
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BCORL1Q5H9F3 1711 aa17.52■□□□□ 0.4
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PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FKBP8Q14318 412 aa17.51■□□□□ 0.39
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