RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.46■■■□□ 2.47
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
UPK3BP1-201ENST00000428678 MLECQ14165 292 aa30.44■■■□□ 2.46
UPK3BP1-201ENST00000428678 HSPA2P54652 639 aa30.42■■■□□ 2.46
UPK3BP1-201ENST00000428678 FMN1Q68DA7 1419 aa30.4■■■□□ 2.46
UPK3BP1-201ENST00000428678 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa30.39■■■□□ 2.46
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.39■■■□□ 2.45
UPK3BP1-201ENST00000428678 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.36■■■□□ 2.45
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.35■■■□□ 2.45
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP10AO60312 1499 aa30.33■■■□□ 2.45
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIF14Q15058 1648 aa30.32■■■□□ 2.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.3■■■□□ 2.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.27■■■□□ 2.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.27■■■□□ 2.44
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa30.25■■■□□ 2.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLIP1P30622 1438 aa30.24■■■□□ 2.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYT1LQ9UL68 1186 aa30.21■■■□□ 2.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 AFAP1Q8N556 730 aa30.2■■■□□ 2.43
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.19■■■□□ 2.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 KDM5CP41229 1560 aa30.19■■■□□ 2.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.18■■■□□ 2.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.15■■■□□ 2.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 CERKQ8TCT0 537 aa30.15■■■□□ 2.42
UPK3BP1-201ENST00000428678 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.13■■■□□ 2.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.13■■■□□ 2.41
UPK3BP1-201ENST00000428678 PREX2Q70Z35 1606 aa30.07■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCA6Q8N139 1617 aa30.07■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 REREQ9P2R6 1566 aa30.07■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 MLH3Q9UHC1 1453 aa30.06■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.05■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.05■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCC1P33527 1531 aa30.04■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.04■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa30.04■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITSN2Q9NZM3 1697 aa30.01■■■□□ 2.4
UPK3BP1-201ENST00000428678 STRCQ7RTU9 1775 aa30■■■□□ 2.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30■■■□□ 2.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 C3P01024 1663 aa29.98■■■□□ 2.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 AGLP35573 1532 aa29.97■■■□□ 2.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.96■■■□□ 2.39
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.94■■■□□ 2.38
UPK3BP1-201ENST00000428678 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.92■■■□□ 2.38
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
UPK3BP1-201ENST00000428678 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.87■■■□□ 2.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.86■■■□□ 2.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPRTO14522 1441 aa29.84■■■□□ 2.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.84■■■□□ 2.37
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 MROH2AA6NES4 1674 aa29.76■■■□□ 2.36
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCOA1Q15788 1441 aa29.76■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP7AQ04656 1500 aa29.74■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 NPATQ14207 1427 aa29.73■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZMYM3Q14202 1370 aa29.72■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCNB3Q8WWL7 1395 aa29.72■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.72■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.71■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.7■■■□□ 2.35
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.7■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.69■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 A2MP01023 1474 aa29.68■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.67■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLXNC1O60486 1568 aa29.67■■■□□ 2.34
UPK3BP1-201ENST00000428678 GGT6Q6P531 493 aa29.62■■■□□ 2.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.61■■■□□ 2.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.61■■■□□ 2.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.6■■■□□ 2.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.58■■■□□ 2.33
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPRKQ15262 1439 aa29.57■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 ILDR2Q71H61 639 aa29.57■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 TIAM1Q13009 1591 aa29.56■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.53■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.53■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 PLA2R1Q13018 1463 aa29.53■■■□□ 2.32
UPK3BP1-201ENST00000428678 PKD2Q13563 968 aa29.51■■■□□ 2.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.5■■■□□ 2.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 MBD5Q9P267 1494 aa29.49■■■□□ 2.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.45■■■□□ 2.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 CEP162Q5TB80 1403 aa29.45■■■□□ 2.31
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.44■■■□□ 2.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 SOCS7O14512 581 aa29.44■■■□□ 2.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.42■■■□□ 2.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.38■■■□□ 2.29
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