RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 ABCC5O15440 1437 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.22e-34■■■■□ 20.9
ACTB-204ENST00000425660 ROCK1Q13464 1354 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-204ENST00000425660 PREX2Q70Z35 1606 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-204ENST00000425660 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-204ENST00000425660 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-204ENST00000425660 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.46■■□□□ 1.19
ACTB-204ENST00000425660 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.45■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.44■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 MAPKBP1O60336 1514 aa22.43■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 ADGRL2O95490 1459 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.42■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 MBD5Q9P267 1494 aa22.41■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 PLCH2O75038 1416 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 KCNH8Q96L42 1107 aa22.4■■□□□ 1.18
ACTB-204ENST00000425660 NCOA1Q15788 1441 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ASXL2Q76L83 1435 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 KDM6BO15054 1643 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.33■■□□□ 1.17
ACTB-204ENST00000425660 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.32■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.3■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.163e-29■□□□□ 9.6
ACTB-204ENST00000425660 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 TSPY4P0CV99 314 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 TSPY10P0CW01 314 aa22.29■■□□□ 1.16
ACTB-204ENST00000425660 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.27■■□□□ 1.15
ACTB-204ENST00000425660 ABCC1P33527 1531 aa22.26■■□□□ 1.15
ACTB-204ENST00000425660 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.25■■□□□ 1.15
ACTB-204ENST00000425660 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-204ENST00000425660 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-204ENST00000425660 FANCAO15360 1455 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-204ENST00000425660 KIF15Q9NS87 1388 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-204ENST00000425660 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-204ENST00000425660 TRIM52Q96A61 297 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-204ENST00000425660 PLXNC1O60486 1568 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-204ENST00000425660 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-204ENST00000425660 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 CD109Q6YHK3 1445 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 PZPP20742 1482 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 ADGRL1O94910 1474 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTB-204ENST00000425660 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 NEUROD1Q13562 356 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 GLI2P10070 1586 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 ERBINQ96RT1 1412 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 AFAP1Q8N556 730 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-204ENST00000425660 NUP155O75694 1391 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 NEO1Q92859 1461 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 UNC13BO14795 1591 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 ATP7AQ04656 1500 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 TONSLQ96HA7 1378 aa21.99■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 FOXD1Q16676 465 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 KDM5CP41229 1560 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 DIP2BQ9P265 1576 aa21.96■■□□□ 1.11
ACTB-204ENST00000425660 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-204ENST00000425660 PKD2Q13563 968 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-204ENST00000425660 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-204ENST00000425660 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-204ENST00000425660 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-204ENST00000425660 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-204ENST00000425660 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-204ENST00000425660 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ACTB-204ENST00000425660 DEPDC5O75140 1603 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms