RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412333.1

MESTP4-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MESTP4, Length 1,204 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP4-201ENST00000412333 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.2■□□□□ 0.66
MESTP4-201ENST00000412333 STRCQ7RTU9 1775 aa19.19■□□□□ 0.66
MESTP4-201ENST00000412333 HECW1Q76N89 1606 aa19.18■□□□□ 0.66
MESTP4-201ENST00000412333 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
MESTP4-201ENST00000412333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
MESTP4-201ENST00000412333 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa19.13■□□□□ 0.65
MESTP4-201ENST00000412333 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
MESTP4-201ENST00000412333 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.09■□□□□ 0.65
MESTP4-201ENST00000412333 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.07■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 C9orf84Q5VXU9 1444 aa19.06■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa19.06■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.05■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 DMRT2Q9Y5R5 561 aa19.04■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 ATP10AO60312 1499 aa19.03■□□□□ 0.64
MESTP4-201ENST00000412333 C3P01024 1663 aa19.01■□□□□ 0.63
MESTP4-201ENST00000412333 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19■□□□□ 0.63
MESTP4-201ENST00000412333 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19■□□□□ 0.63
MESTP4-201ENST00000412333 PTPRTO14522 1441 aa18.97■□□□□ 0.63
MESTP4-201ENST00000412333 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
MESTP4-201ENST00000412333 PLCH2O75038 1416 aa18.95■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa18.94■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 FOXD1Q16676 465 aa18.93■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 MYT1LQ9UL68 1186 aa18.93■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 ABCA6Q8N139 1617 aa18.92■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 KIF14Q15058 1648 aa18.92■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.9■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa18.9■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 KDM5CP41229 1560 aa18.9■□□□□ 0.62
MESTP4-201ENST00000412333 NCOA1Q15788 1441 aa18.89■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.89■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.88■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.86■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.85■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 AFAP1Q8N556 730 aa18.85■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.84■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 REREQ9P2R6 1566 aa18.84■□□□□ 0.61
MESTP4-201ENST00000412333 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.83■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.8■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.78■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.77■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 AGLP35573 1532 aa18.77■□□□□ 0.6
MESTP4-201ENST00000412333 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.76■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.76■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 MLH3Q9UHC1 1453 aa18.75■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 MROH2AA6NES4 1674 aa18.75■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa18.75■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 ABCC1P33527 1531 aa18.74■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 PREX2Q70Z35 1606 aa18.74■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.73■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.72■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 CLIP1P30622 1438 aa18.71■□□□□ 0.59
MESTP4-201ENST00000412333 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 NPATQ14207 1427 aa18.69■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 PIP4K2BP78356 416 aa18.69■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 HSPA1LP34931 641 aa18.68■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 FMN1Q68DA7 1419 aa18.67■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 EEA1Q15075 1411 aa18.66■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.65■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 PLA2R1Q13018 1463 aa18.65■□□□□ 0.58
MESTP4-201ENST00000412333 ZMYM3Q14202 1370 aa18.64■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.64■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.63■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.62■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.6■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 PKD2Q13563 968 aa18.6■□□□□ 0.57
MESTP4-201ENST00000412333 PTPRKQ15262 1439 aa18.57■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 ATP7AQ04656 1500 aa18.56■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 PLXNC1O60486 1568 aa18.55■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.55■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 CPS1P31327 1500 aa18.54■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 TOM1O60784 492 aa18.53■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
MESTP4-201ENST00000412333 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.52■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 GGT6Q6P531 493 aa18.51■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 A2MP01023 1474 aa18.51■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 SHANK2Q9UPX8 1470 aa18.51■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 ALKQ9UM73 1620 aa18.5■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.49■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.47■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.47■□□□□ 0.55
MESTP4-201ENST00000412333 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.42■□□□□ 0.54
MESTP4-201ENST00000412333 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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