RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 AKNAQ7Z591 1439 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 DAPK1P53355 1430 aa14.59□□□□□ -0.07
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.57□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.57□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC5O15440 1437 aa14.56□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ROCK1Q13464 1354 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.53□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.52□□□□□ -0.08
LRRTM4-202ENST00000409093 KDM6BO15054 1643 aa14.52□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.51□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 PREX2Q70Z35 1606 aa14.5□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 NEUROD1Q13562 356 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 TRIM52Q96A61 297 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRTM4-202ENST00000409093 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.46□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ADGRL2O95490 1459 aa14.45□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 OSCARQ8IYS5 282 aa14.45□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.45□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.44□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 NCOA1Q15788 1441 aa14.44□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.43□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.43□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.43□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.42□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.42□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNH8Q96L42 1107 aa14.42□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
LRRTM4-202ENST00000409093 MBD5Q9P267 1494 aa14.39□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.39□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TONSLQ96HA7 1378 aa14.39□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TSPY4P0CV99 314 aa14.39□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 TSPY10P0CW01 314 aa14.39□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.39□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.38□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.38□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.36□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.35□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.35□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.35□□□□□ -0.11
LRRTM4-202ENST00000409093 PLCH2O75038 1416 aa14.35□□□□□ -0.11
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LRRTM4-202ENST00000409093 KIF15Q9NS87 1388 aa14.33□□□□□ -0.12
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LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.33□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PZPP20742 1482 aa14.32□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.32□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 FOXD1Q16676 465 aa14.31□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.3□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCC1P33527 1531 aa14.3□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.3□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ASXL2Q76L83 1435 aa14.29□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.29□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa14.29□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.29□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 PLXNC1O60486 1568 aa14.28□□□□□ -0.12
LRRTM4-202ENST00000409093 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.27□□□□□ -0.13
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LRRTM4-202ENST00000409093 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.26□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 NUP155O75694 1391 aa14.26□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 FANCAO15360 1455 aa14.23□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 PKD2Q13563 968 aa14.23□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.23□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.22□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.22□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 UNC13BO14795 1591 aa14.21□□□□□ -0.13
LRRTM4-202ENST00000409093 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.2□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 MIER1Q8N108 512 aa14.2□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.2□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.2□□□□□ -0.14
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LRRTM4-202ENST00000409093 ADGRL1O94910 1474 aa14.18□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.18□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.17□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 AFAP1Q8N556 730 aa14.17□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.16□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.15□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.15□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 ATP7AQ04656 1500 aa14.15□□□□□ -0.14
LRRTM4-202ENST00000409093 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.14□□□□□ -0.15
LRRTM4-202ENST00000409093 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.14□□□□□ -0.15
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