RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 HECW1Q76N89 1606 aa15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.2■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 POTEHQ6S545 545 aa15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.19■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLCH2O75038 1416 aa15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPRMP28827 1452 aa15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 RICTORQ6R327 1708 aa15.14■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAP3K1Q13233 1512 aa15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIF14Q15058 1648 aa15.1■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 MADDQ8WXG6 1647 aa15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCDC18Q5T9S5 1454 aa15.09■□□□□ 0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.08■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 YEATS2Q9ULM3 1422 aa15.08■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.07■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP10AO60312 1499 aa15.07■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.07■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.06■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.05■□□□□ 0
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
APOBEC3G-201ENST00000407997 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.04■□□□□ -0
APOBEC3G-201ENST00000407997 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
APOBEC3G-201ENST00000407997 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.02□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 MLECQ14165 292 aa15.01□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.01□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 AFAP1Q8N556 730 aa15□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 KDM5CP41229 1560 aa14.99□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.98□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.98□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLPPR3Q6T4P5 718 aa14.97□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXO41Q8TF61 875 aa14.97□□□□□ -0.01
APOBEC3G-201ENST00000407997 PREX2Q70Z35 1606 aa14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 REREQ9P2R6 1566 aa14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.95□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABCC1P33527 1531 aa14.94□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 TIAM1Q13009 1591 aa14.93□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.92□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.92□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSPA2P54652 639 aa14.92□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.91□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGLP35573 1532 aa14.91□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.9□□□□□ -0.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.89□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.88□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABCA6Q8N139 1617 aa14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.86□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.84□□□□□ -0.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.82□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADRA2BP18089 450 aa14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 CERKQ8TCT0 537 aa14.81□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP7AQ04656 1500 aa14.79□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 NPATQ14207 1427 aa14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 A2MP01023 1474 aa14.78□□□□□ -0.04
APOBEC3G-201ENST00000407997 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.77□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 C3P01024 1663 aa14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZMYM3Q14202 1370 aa14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPRTO14522 1441 aa14.75□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 MROH2AA6NES4 1674 aa14.74□□□□□ -0.05
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLXNC1O60486 1568 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms