RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405675.7

CSNK1E-205, Transcript of casein kinase 1 epsilon, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CSNK1E, Length 2,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1E-205ENST00000405675 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.44■■■■■ 4.388e-8■■□□□ 12.3
CSNK1E-205ENST00000405675 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.42■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.41■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 TTC37Q6PGP7 1564 aa42.41■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.4■■■■■ 4.38
CSNK1E-205ENST00000405675 DAPK1P53355 1430 aa42.37■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.37■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.36■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 AKNAQ7Z591 1439 aa42.36■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.35■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC5O15440 1437 aa42.35■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.34■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 ASXL2Q76L83 1435 aa42.32■■■■■ 4.37
CSNK1E-205ENST00000405675 PREX2Q70Z35 1606 aa42.31■■■■■ 4.36
CSNK1E-205ENST00000405675 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.3■■■■■ 4.36
CSNK1E-205ENST00000405675 SIN3AQ96ST3 1273 aa42.28■■■■■ 4.36
CSNK1E-205ENST00000405675 KDM6BO15054 1643 aa42.25■■■■■ 4.35
CSNK1E-205ENST00000405675 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CSNK1E-205ENST00000405675 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.21■■■■■ 4.35
CSNK1E-205ENST00000405675 ROCK1Q13464 1354 aa42.21■■■■■ 4.35
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.2■■■■■ 4.35
CSNK1E-205ENST00000405675 PLCH2O75038 1416 aa42.17■■■■■ 4.34
CSNK1E-205ENST00000405675 NEUROD1Q13562 356 aa42.17■■■■■ 4.34
CSNK1E-205ENST00000405675 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.16■■■■■ 4.34
CSNK1E-205ENST00000405675 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.13■■■■■ 4.34
CSNK1E-205ENST00000405675 MBD5Q9P267 1494 aa42.07■■■■■ 4.32
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.06■■■■■ 4.32
CSNK1E-205ENST00000405675 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.05■■■■■ 4.32
CSNK1E-205ENST00000405675 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.04■■■■■ 4.32
CSNK1E-205ENST00000405675 TRIM52Q96A61 297 aa42.02■■■■■ 4.32
CSNK1E-205ENST00000405675 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGEF5Q12774 1597 aa42■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.99■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 NCOA1Q15788 1441 aa41.98■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.97■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.96■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 ADGRL2O95490 1459 aa41.96■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.96■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 TSPY4P0CV99 314 aa41.95■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 TSPY10P0CW01 314 aa41.95■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.94■■■■■ 4.31
CSNK1E-205ENST00000405675 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.94■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.94■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.94■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.93■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.93■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa41.92■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.89■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 MPHOSPH9Q99550 1183 aa41.89■■■■■ 4.3
CSNK1E-205ENST00000405675 FANCAO15360 1455 aa41.86■■■■■ 4.29
CSNK1E-205ENST00000405675 ABCC1P33527 1531 aa41.86■■■■■ 4.29
CSNK1E-205ENST00000405675 CD109Q6YHK3 1445 aa41.81■■■■■ 4.28
CSNK1E-205ENST00000405675 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
CSNK1E-205ENST00000405675 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CSNK1E-205ENST00000405675 TONSLQ96HA7 1378 aa41.78■■■■■ 4.28
CSNK1E-205ENST00000405675 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa41.77■■■■■ 4.28
CSNK1E-205ENST00000405675 FOXD1Q16676 465 aa41.73■■■■■ 4.27
CSNK1E-205ENST00000405675 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.71■■■■■ 4.27
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF15Q9NS87 1388 aa41.7■■■■■ 4.27
CSNK1E-205ENST00000405675 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.69■■■■■ 4.26
CSNK1E-205ENST00000405675 ADGRL1O94910 1474 aa41.68■■■■■ 4.26
CSNK1E-205ENST00000405675 AFAP1Q8N556 730 aa41.68■■■■■ 4.26
CSNK1E-205ENST00000405675 PZPP20742 1482 aa41.67■■■■■ 4.26
CSNK1E-205ENST00000405675 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.65■■■■■ 4.26
CSNK1E-205ENST00000405675 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
CSNK1E-205ENST00000405675 GLI2P10070 1586 aa41.61■■■■■ 4.25
CSNK1E-205ENST00000405675 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa41.6■■■■■ 4.25
CSNK1E-205ENST00000405675 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.59■■■■■ 4.25
CSNK1E-205ENST00000405675 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.58■■■■■ 4.25
CSNK1E-205ENST00000405675 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
CSNK1E-205ENST00000405675 DIP2BQ9P265 1576 aa41.56■■■■■ 4.24
CSNK1E-205ENST00000405675 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.55■■■■■ 4.24
CSNK1E-205ENST00000405675 PLXNC1O60486 1568 aa41.55■■■■■ 4.24
CSNK1E-205ENST00000405675 MIER1Q8N108 512 aa41.54■■■■■ 4.24
CSNK1E-205ENST00000405675 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.49■■■■■ 4.23
CSNK1E-205ENST00000405675 NEO1Q92859 1461 aa41.47■■■■■ 4.23
CSNK1E-205ENST00000405675 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.47■■■■■ 4.23
CSNK1E-205ENST00000405675 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 NUP155O75694 1391 aa41.43■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.42■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.4■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 ATP7AQ04656 1500 aa41.4■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 PKD2Q13563 968 aa41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.39■■■■■ 4.22
CSNK1E-205ENST00000405675 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.38■■■■■ 4.21
CSNK1E-205ENST00000405675 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.38■■■■■ 4.21
CSNK1E-205ENST00000405675 ERBINQ96RT1 1412 aa41.32■■■■■ 4.21
CSNK1E-205ENST00000405675 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
CSNK1E-205ENST00000405675 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.3■■■■■ 4.2
CSNK1E-205ENST00000405675 RAPGEF3O95398 923 aa41.3■■■■■ 4.2
CSNK1E-205ENST00000405675 TSPOAP1O95153 1857 aa41.3■■■■■ 4.2
CSNK1E-205ENST00000405675 KDM5CP41229 1560 aa41.29■■■■■ 4.2
CSNK1E-205ENST00000405675 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.27■■■■■ 4.2
CSNK1E-205ENST00000405675 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.26■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms