RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 SAMD9Q5K651 1589 aa20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 ERCC6Q03468 1493 aa20.63■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 IQGAP2Q13576 1575 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 MRS2Q9HD23 443 aa20.61■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.6■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.59■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ATG4B-206ENST00000405546 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.58■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC184Q52MB2 194 aa20.58■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 JPH4Q96JJ6 628 aa20.58■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.57■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 PKD2Q13563 968 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 HECW1Q76N89 1606 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.55■□□□□ 0.88
ATG4B-206ENST00000405546 TSPY4P0CV99 314 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 TSPY10P0CW01 314 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 MIA2Q96PC5 1412 aa20.51■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 DAPK1P53355 1430 aa20.49■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 KDM6BO15054 1643 aa20.48■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 IFT140Q96RY7 1462 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 ABCC5O15440 1437 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.47■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.876e-14■■□□□ 12
ATG4B-206ENST00000405546 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 21.8
ATG4B-206ENST00000405546 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.46■□□□□ 0.87
ATG4B-206ENST00000405546 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 ADAMTS12P58397 1594 aa20.45■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 PBRM1Q86U86 1689 aa20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 RGL3Q3MIN7 710 aa20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 CCDC7Q96M83 1385 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 WDR62O43379 1518 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 IL27Q8NEV9 243 aa20.42■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 NUP155O75694 1391 aa20.41■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 GRIN2AQ12879 1464 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-206ENST00000405546 ARHGEF11O15085 1522 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 DISP1Q96F81 1524 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.37■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 ROCK1Q13464 1354 aa20.34■□□□□ 0.85
ATG4B-206ENST00000405546 TMC1Q8TDI8 760 aa20.33■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 AKNAQ7Z591 1439 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA0556O60303 1618 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 NCOA1Q15788 1441 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.3■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 USP47Q96K76 1375 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ATG4B-206ENST00000405546 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 SYNJ2O15056 1496 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 PTPRGP23470 1445 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG4B-206ENST00000405546 KIF15Q9NS87 1388 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 PZPP20742 1482 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.18■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 KIF14Q15058 1648 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 CEP170Q5SW79 1584 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 ATP10BO94823 1461 aa20.14■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
ATG4B-206ENST00000405546 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-206ENST00000405546 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ATG4B-206ENST00000405546 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-206ENST00000405546 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ATG4B-206ENST00000405546 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.1■□□□□ 0.81
ATG4B-206ENST00000405546 NEFMP07197 916 aa20.09■□□□□ 0.81
ATG4B-206ENST00000405546 SKAP1Q86WV1 359 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.9 ms