RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403027.6

CNOT8-202, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT8, Length 2,604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8-202ENST00000403027 DAPK1P53355 1430 aa22.49■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 FOXD1Q16676 465 aa22.45■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.45■■□□□ 1.19
CNOT8-202ENST00000403027 AKNAQ7Z591 1439 aa22.45■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.44■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 KCNH8Q96L42 1107 aa22.44■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 KIF14Q15058 1648 aa22.43■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.43■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 ATP10BO94823 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 ROCK1Q13464 1354 aa22.39■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 ABCA8O94911 1581 aa22.39■■□□□ 1.18
CNOT8-202ENST00000403027 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
CNOT8-202ENST00000403027 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.37■■□□□ 1.17
CNOT8-202ENST00000403027 CHD1O14646 1710 aa22.33■■□□□ 1.17
CNOT8-202ENST00000403027 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 NCOA1Q15788 1441 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.31■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.28■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.27■■□□□ 1.16
CNOT8-202ENST00000403027 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.24■■□□□ 1.15
CNOT8-202ENST00000403027 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.153e-7■■■■□ 21.6
CNOT8-202ENST00000403027 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT8-202ENST00000403027 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.23■■□□□ 1.15
CNOT8-202ENST00000403027 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.2■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 TSPY4P0CV99 314 aa22.18■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 TSPY10P0CW01 314 aa22.18■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 ADGRL2O95490 1459 aa22.17■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 PZPP20742 1482 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 SHROOM2Q13796 1616 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.16■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.14■■□□□ 1.14
CNOT8-202ENST00000403027 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.14■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 PKD2Q13563 968 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.13■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 MBD5Q9P267 1494 aa22.1■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 NUP155O75694 1391 aa22.08■■□□□ 1.13
CNOT8-202ENST00000403027 ANP32CO43423 234 aa22.08■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.07■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 KIF15Q9NS87 1388 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.06■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 ABCC2Q92887 1545 aa22.05■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.03■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
CNOT8-202ENST00000403027 PREX2Q70Z35 1606 aa22■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 CLASP1Q7Z460 1538 aa22■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.99■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.97■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 CCER2I3L3R5 266 aa21.96■■□□□ 1.11
CNOT8-202ENST00000403027 BCANQ96GW7 911 aa21.94■■□□□ 1.1
CNOT8-202ENST00000403027 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.11e-8■□□□□ 11.1
CNOT8-202ENST00000403027 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.9■■□□□ 1.1
CNOT8-202ENST00000403027 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
CNOT8-202ENST00000403027 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CNOT8-202ENST00000403027 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.88■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC7Q96M83 1385 aa21.88■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 PLCH2O75038 1416 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.87■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.86■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.86■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.85■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.83■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.83■■□□□ 1.09
CNOT8-202ENST00000403027 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.82■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 AFAP1Q8N556 730 aa21.81■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.8■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 USP47Q96K76 1375 aa21.8■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.79■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 RGL3Q3MIN7 710 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC184Q52MB2 194 aa21.78■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.77■■□□□ 1.08
CNOT8-202ENST00000403027 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.76■■□□□ 1.07
CNOT8-202ENST00000403027 FKBP8Q14318 412 aa21.76■■□□□ 1.07
CNOT8-202ENST00000403027 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CNOT8-202ENST00000403027 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.75■■□□□ 1.07
CNOT8-202ENST00000403027 PLA2R1Q13018 1463 aa21.74■■□□□ 1.07
CNOT8-202ENST00000403027 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.73■■□□□ 1.07
CNOT8-202ENST00000403027 PLXNC1O60486 1568 aa21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms