RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397098.7

C7orf50-202, Transcript of chromosome 7 open reading frame 50, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C7orf50, Length 2,131 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf50-202ENST00000397098 ROCK1Q13464 1354 aa41.05■■■■■ 4.16
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C7orf50-202ENST00000397098 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.97■■■■■ 4.15
C7orf50-202ENST00000397098 ABCC10Q5T3U5 1492 aa40.97■■■■■ 4.15
C7orf50-202ENST00000397098 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.96■■■■■ 4.15
C7orf50-202ENST00000397098 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
C7orf50-202ENST00000397098 KDM6BO15054 1643 aa40.91■■■■■ 4.14
C7orf50-202ENST00000397098 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
C7orf50-202ENST00000397098 TRIM52Q96A61 297 aa40.88■■■■■ 4.14
C7orf50-202ENST00000397098 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.86■■■■■ 4.13
C7orf50-202ENST00000397098 ABCC2Q92887 1545 aa40.83■■■■■ 4.13
C7orf50-202ENST00000397098 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
C7orf50-202ENST00000397098 NCOA1Q15788 1441 aa40.76■■■■■ 4.12
C7orf50-202ENST00000397098 TONSLQ96HA7 1378 aa40.75■■■■■ 4.11
C7orf50-202ENST00000397098 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.75■■■■■ 4.11
C7orf50-202ENST00000397098 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
C7orf50-202ENST00000397098 ADGRL2O95490 1459 aa40.72■■■■■ 4.11
C7orf50-202ENST00000397098 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.71■■■■■ 4.11
C7orf50-202ENST00000397098 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.7■■■■■ 4.11
C7orf50-202ENST00000397098 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.67■■■■■ 4.1
C7orf50-202ENST00000397098 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa40.65■■■■■ 4.1
C7orf50-202ENST00000397098 MIER1Q8N108 512 aa40.64■■■■■ 4.1
C7orf50-202ENST00000397098 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.62■■■■■ 4.09
C7orf50-202ENST00000397098 PREX2Q70Z35 1606 aa40.59■■■■■ 4.09
C7orf50-202ENST00000397098 TSPY4P0CV99 314 aa40.58■■■■■ 4.09
C7orf50-202ENST00000397098 TSPY10P0CW01 314 aa40.58■■■■■ 4.09
C7orf50-202ENST00000397098 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.57■■■■■ 4.09
C7orf50-202ENST00000397098 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.56■■■■■ 4.08
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C7orf50-202ENST00000397098 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.54■■■■■ 4.08
C7orf50-202ENST00000397098 MBD5Q9P267 1494 aa40.54■■■■■ 4.08
C7orf50-202ENST00000397098 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
C7orf50-202ENST00000397098 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.52■■■■■ 4.08
C7orf50-202ENST00000397098 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
C7orf50-202ENST00000397098 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.5■■■■■ 4.07
C7orf50-202ENST00000397098 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.5■■■■■ 4.07
C7orf50-202ENST00000397098 FOXD1Q16676 465 aa40.49■■■■■ 4.07
C7orf50-202ENST00000397098 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.49■■■■■ 4.07
C7orf50-202ENST00000397098 KCNH8Q96L42 1107 aa40.48■■■■■ 4.07
C7orf50-202ENST00000397098 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.46■■■■■ 4.07
C7orf50-202ENST00000397098 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.44■■■■■ 4.06
C7orf50-202ENST00000397098 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.44■■■■■ 4.06
C7orf50-202ENST00000397098 PZPP20742 1482 aa40.42■■■■■ 4.06
C7orf50-202ENST00000397098 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.38■■■■■ 4.06
C7orf50-202ENST00000397098 KIF15Q9NS87 1388 aa40.35■■■■■ 4.05
C7orf50-202ENST00000397098 OSCARQ8IYS5 282 aa40.35■■■■■ 4.05
C7orf50-202ENST00000397098 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.33■■■■■ 4.05
C7orf50-202ENST00000397098 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
C7orf50-202ENST00000397098 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.32■■■■■ 4.05
C7orf50-202ENST00000397098 PLCH2O75038 1416 aa40.32■■■■■ 4.05
C7orf50-202ENST00000397098 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.32■■■■■ 4.05
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C7orf50-202ENST00000397098 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.27■■■■■ 4.04
C7orf50-202ENST00000397098 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.24■■■■■ 4.03
C7orf50-202ENST00000397098 NUP155O75694 1391 aa40.24■■■■■ 4.03
C7orf50-202ENST00000397098 PKD2Q13563 968 aa40.23■■■■■ 4.03
C7orf50-202ENST00000397098 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.22■■■■■ 4.03
C7orf50-202ENST00000397098 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
C7orf50-202ENST00000397098 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.18■■■■■ 4.02
C7orf50-202ENST00000397098 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.16■■■■■ 4.02
C7orf50-202ENST00000397098 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.15■■■■■ 4.02
C7orf50-202ENST00000397098 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.13■■■■■ 4.02
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C7orf50-202ENST00000397098 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
C7orf50-202ENST00000397098 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.09■■■■■ 4.01
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C7orf50-202ENST00000397098 ABCC1P33527 1531 aa40.06■■■■■ 4
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C7orf50-202ENST00000397098 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.97■■■■□ 3.99
C7orf50-202ENST00000397098 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.97■■■■□ 3.99
C7orf50-202ENST00000397098 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP39.96■■■■□ 3.991e-6■■■■■ 38.9
C7orf50-202ENST00000397098 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.96■■■■□ 3.99
C7orf50-202ENST00000397098 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.96■■■■□ 3.99
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C7orf50-202ENST00000397098 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.93■■■■□ 3.982e-6■■■■■ 46
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C7orf50-202ENST00000397098 ERBINQ96RT1 1412 aa39.89■■■■□ 3.98
C7orf50-202ENST00000397098 FANCAO15360 1455 aa39.88■■■■□ 3.98
C7orf50-202ENST00000397098 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
C7orf50-202ENST00000397098 AFAP1Q8N556 730 aa39.85■■■■□ 3.97
C7orf50-202ENST00000397098 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.85■■■■□ 3.97
C7orf50-202ENST00000397098 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.971e-7■□□□□ 10.9
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C7orf50-202ENST00000397098 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.75■■■■□ 3.95
C7orf50-202ENST00000397098 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.74■■■■□ 3.95
C7orf50-202ENST00000397098 WASHC2AQ641Q2 1341 aa39.73■■■■□ 3.95
C7orf50-202ENST00000397098 ADGRL1O94910 1474 aa39.72■■■■□ 3.95
C7orf50-202ENST00000397098 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.71■■■■□ 3.95
C7orf50-202ENST00000397098 ANP32CO43423 234 aa39.7■■■■□ 3.95
C7orf50-202ENST00000397098 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.69■■■■□ 3.94
C7orf50-202ENST00000397098 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.69■■■■□ 3.94
C7orf50-202ENST00000397098 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.67■■■■□ 3.94
C7orf50-202ENST00000397098 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.67■■■■□ 3.94
C7orf50-202ENST00000397098 PLA2R1Q13018 1463 aa39.63■■■■□ 3.94
C7orf50-202ENST00000397098 ATP7AQ04656 1500 aa39.63■■■■□ 3.94
C7orf50-202ENST00000397098 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
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