RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393119.6

MKS1-202, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKS1, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-202ENST00000393119 KDM6BO15054 1643 aa21.97■■□□□ 1.11
MKS1-202ENST00000393119 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.97■■□□□ 1.11
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MKS1-202ENST00000393119 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.93■■□□□ 1.1
MKS1-202ENST00000393119 TRIM52Q96A61 297 aa21.92■■□□□ 1.1
MKS1-202ENST00000393119 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.91■■□□□ 1.1
MKS1-202ENST00000393119 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 FOXD1Q16676 465 aa21.88■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.88■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.87■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.86■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.86■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 AKNAQ7Z591 1439 aa21.85■■□□□ 1.09
MKS1-202ENST00000393119 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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MKS1-202ENST00000393119 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.8■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 ROCK1Q13464 1354 aa21.79■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.78■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.78■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.78■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.77■■□□□ 1.08
MKS1-202ENST00000393119 MBD5Q9P267 1494 aa21.77■■□□□ 1.08
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MKS1-202ENST00000393119 TSPY10P0CW01 314 aa21.75■■□□□ 1.07
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MKS1-202ENST00000393119 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.74■■□□□ 1.07
MKS1-202ENST00000393119 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.72■■□□□ 1.07
MKS1-202ENST00000393119 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.72■■□□□ 1.07
MKS1-202ENST00000393119 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.71■■□□□ 1.07
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MKS1-202ENST00000393119 ASXL2Q76L83 1435 aa21.7■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 PLCH2O75038 1416 aa21.69■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.69■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.69■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 ADGRL2O95490 1459 aa21.67■■□□□ 1.06
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MKS1-202ENST00000393119 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.66■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.66■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 AFAP1Q8N556 730 aa21.66■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 KIF15Q9NS87 1388 aa21.65■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.65■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.65■■□□□ 1.06
MKS1-202ENST00000393119 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.63■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.62■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.61■■□□□ 1.05
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MKS1-202ENST00000393119 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.6■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 TONSLQ96HA7 1378 aa21.6■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 PKD2Q13563 968 aa21.58■■□□□ 1.05
MKS1-202ENST00000393119 NUP155O75694 1391 aa21.57■■□□□ 1.04
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MKS1-202ENST00000393119 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.55■■□□□ 1.04
MKS1-202ENST00000393119 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.55■■□□□ 1.04
MKS1-202ENST00000393119 FANCAO15360 1455 aa21.53■■□□□ 1.04
MKS1-202ENST00000393119 ABCC1P33527 1531 aa21.52■■□□□ 1.04
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MKS1-202ENST00000393119 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.5■■□□□ 1.03
MKS1-202ENST00000393119 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.5■■□□□ 1.03
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MKS1-202ENST00000393119 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.49■■□□□ 1.03
MKS1-202ENST00000393119 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.49■■□□□ 1.03
MKS1-202ENST00000393119 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.49■■□□□ 1.03
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MKS1-202ENST00000393119 CD109Q6YHK3 1445 aa21.45■■□□□ 1.02
MKS1-202ENST00000393119 ADGRL1O94910 1474 aa21.44■■□□□ 1.02
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MKS1-202ENST00000393119 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.43■■□□□ 1.02
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MKS1-202ENST00000393119 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.33■■□□□ 1.01
MKS1-202ENST00000393119 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.33■■□□□ 1.01
MKS1-202ENST00000393119 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.32■■□□□ 1
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MKS1-202ENST00000393119 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 ATP7AQ04656 1500 aa21.3■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.3■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.29■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 ERBINQ96RT1 1412 aa21.29■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 MYT1Q01538 1121 aa21.28■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 PLA2R1Q13018 1463 aa21.28■■□□□ 1
MKS1-202ENST00000393119 RGL3Q3MIN7 710 aa21.28■■□□□ 1
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