RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.77■■■■□ 3.32
SERF1B-201ENST00000380750 MAPKBP1O60336 1514 aa35.77■■■■□ 3.32
SERF1B-201ENST00000380750 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
SERF1B-201ENST00000380750 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.74■■■■□ 3.31
SERF1B-201ENST00000380750 ROCK1Q13464 1354 aa35.73■■■■□ 3.31
SERF1B-201ENST00000380750 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.71■■■■□ 3.31
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
SERF1B-201ENST00000380750 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.63■■■■□ 3.29
SERF1B-201ENST00000380750 PREX2Q70Z35 1606 aa35.62■■■■□ 3.29
SERF1B-201ENST00000380750 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.6■■■■□ 3.29
SERF1B-201ENST00000380750 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.58■■■■□ 3.29
SERF1B-201ENST00000380750 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.57■■■■□ 3.28
SERF1B-201ENST00000380750 KDM6BO15054 1643 aa35.54■■■■□ 3.28
SERF1B-201ENST00000380750 ADGRL2O95490 1459 aa35.54■■■■□ 3.28
SERF1B-201ENST00000380750 ADGBQ8N7X0 1667 aa35.52■■■■□ 3.28
SERF1B-201ENST00000380750 KCNH8Q96L42 1107 aa35.52■■■■□ 3.28
SERF1B-201ENST00000380750 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.51■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.5■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 NCOA1Q15788 1441 aa35.5■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.49■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.48■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.47■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 MBD5Q9P267 1494 aa35.47■■■■□ 3.27
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.44■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.43■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.42■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 PLCH2O75038 1416 aa35.42■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.41■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.4■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM52Q96A61 297 aa35.39■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.39■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 TSPY4P0CV99 314 aa35.39■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 TSPY10P0CW01 314 aa35.39■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.39■■■■□ 3.26
SERF1B-201ENST00000380750 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.37■■■■□ 3.25
SERF1B-201ENST00000380750 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.35■■■■□ 3.25
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
SERF1B-201ENST00000380750 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.35■■■■□ 3.25
SERF1B-201ENST00000380750 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.34■■■■□ 3.25
SERF1B-201ENST00000380750 NEUROD1Q13562 356 aa35.33■■■■□ 3.25
SERF1B-201ENST00000380750 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 ASXL2Q76L83 1435 aa35.31■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.31■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.29■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.29■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.27■■■■□ 3.24
SERF1B-201ENST00000380750 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.24■■■■□ 3.23
SERF1B-201ENST00000380750 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.24■■■■□ 3.23
SERF1B-201ENST00000380750 KIF15Q9NS87 1388 aa35.22■■■■□ 3.23
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.2■■■■□ 3.23
SERF1B-201ENST00000380750 ABCC1P33527 1531 aa35.2■■■■□ 3.23
SERF1B-201ENST00000380750 PZPP20742 1482 aa35.14■■■■□ 3.22
SERF1B-201ENST00000380750 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
SERF1B-201ENST00000380750 TONSLQ96HA7 1378 aa35.13■■■■□ 3.21
SERF1B-201ENST00000380750 PLXNC1O60486 1568 aa35.09■■■■□ 3.21
SERF1B-201ENST00000380750 FANCAO15360 1455 aa35.08■■■■□ 3.21
SERF1B-201ENST00000380750 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
SERF1B-201ENST00000380750 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.06■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.06■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 FOXD1Q16676 465 aa35.05■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.04■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.03■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.03■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.03■■■■□ 3.2
SERF1B-201ENST00000380750 NUP155O75694 1391 aa35■■■■□ 3.19
SERF1B-201ENST00000380750 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.96■■■■□ 3.19
SERF1B-201ENST00000380750 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.96■■■■□ 3.19
SERF1B-201ENST00000380750 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.95■■■■□ 3.19
SERF1B-201ENST00000380750 ADGRL1O94910 1474 aa34.93■■■■□ 3.18
SERF1B-201ENST00000380750 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
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SERF1B-201ENST00000380750 AFAP1Q8N556 730 aa34.92■■■■□ 3.18
SERF1B-201ENST00000380750 CD109Q6YHK3 1445 aa34.92■■■■□ 3.18
SERF1B-201ENST00000380750 ERBINQ96RT1 1412 aa34.9■■■■□ 3.18
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SERF1B-201ENST00000380750 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.89■■■■□ 3.18
SERF1B-201ENST00000380750 UNC13BO14795 1591 aa34.88■■■■□ 3.17
SERF1B-201ENST00000380750 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.85■■■■□ 3.17
SERF1B-201ENST00000380750 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.83■■■■□ 3.17
SERF1B-201ENST00000380750 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.82■■■■□ 3.17
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SERF1B-201ENST00000380750 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.78■■■■□ 3.16
SERF1B-201ENST00000380750 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.77■■■■□ 3.16
SERF1B-201ENST00000380750 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.76■■■■□ 3.16
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa34.74■■■■□ 3.15
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SERF1B-201ENST00000380750 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.69■■■■□ 3.14
SERF1B-201ENST00000380750 GLI2P10070 1586 aa34.69■■■■□ 3.14
SERF1B-201ENST00000380750 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.67■■■■□ 3.14
SERF1B-201ENST00000380750 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.67■■■■□ 3.14
SERF1B-201ENST00000380750 KDM5CP41229 1560 aa34.64■■■■□ 3.14
SERF1B-201ENST00000380750 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.63■■■■□ 3.13
SERF1B-201ENST00000380750 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.63■■■■□ 3.13
SERF1B-201ENST00000380750 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
SERF1B-201ENST00000380750 DEPDC5O75140 1603 aa34.59■■■■□ 3.13
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