RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376510.7

MSRB2-201, Transcript of methionine sulfoxide reductase B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRB2, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2-201ENST00000376510 NAIPQ13075 1403 aa40.37■■■■■ 4.05
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MSRB2-201ENST00000376510 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.3■■■■■ 4.04
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MSRB2-201ENST00000376510 PREX2Q70Z35 1606 aa40.26■■■■■ 4.04
MSRB2-201ENST00000376510 KCNH8Q96L42 1107 aa40.26■■■■■ 4.04
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MSRB2-201ENST00000376510 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.22■■■■■ 4.03
MSRB2-201ENST00000376510 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.22■■■■■ 4.03
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MSRB2-201ENST00000376510 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.16■■■■■ 4.02
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MSRB2-201ENST00000376510 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.13■■■■■ 4.01
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MSRB2-201ENST00000376510 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.1■■■■■ 4.01
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MSRB2-201ENST00000376510 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.04■■■■■ 4
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MSRB2-201ENST00000376510 TSPY10P0CW01 314 aa40.04■■■■■ 4
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MSRB2-201ENST00000376510 ASXL2Q76L83 1435 aa39.99■■■■□ 3.99
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MSRB2-201ENST00000376510 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.96■■■■□ 3.99
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MSRB2-201ENST00000376510 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.91■■■■□ 3.98
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MSRB2-201ENST00000376510 ABCA9Q8IUA7 1624 aa39.87■■■■□ 3.97
MSRB2-201ENST00000376510 NEUROD1Q13562 356 aa39.82■■■■□ 3.97
MSRB2-201ENST00000376510 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.82■■■■□ 3.97
MSRB2-201ENST00000376510 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.79■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.79■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.78■■■■□ 3.96
MSRB2-201ENST00000376510 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.77■■■■□ 3.96
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MSRB2-201ENST00000376510 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.75■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 KIF15Q9NS87 1388 aa39.75■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.72■■■■□ 3.95
MSRB2-201ENST00000376510 FANCAO15360 1455 aa39.69■■■■□ 3.94
MSRB2-201ENST00000376510 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
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MSRB2-201ENST00000376510 CD109Q6YHK3 1445 aa39.56■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 PZPP20742 1482 aa39.56■■■■□ 3.92
MSRB2-201ENST00000376510 ADGRL1O94910 1474 aa39.54■■■■□ 3.92
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MSRB2-201ENST00000376510 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.5■■■■□ 3.91
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MSRB2-201ENST00000376510 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 AFAP1Q8N556 730 aa39.49■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.47■■■■□ 3.91
MSRB2-201ENST00000376510 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.45■■■■□ 3.91
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MSRB2-201ENST00000376510 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.28■■■■□ 3.88
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MSRB2-201ENST00000376510 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
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MSRB2-201ENST00000376510 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.19■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.18■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 DIP2BQ9P265 1576 aa39.16■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.15■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.15■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 KDM5CP41229 1560 aa39.15■■■■□ 3.86
MSRB2-201ENST00000376510 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
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