RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375011.3

GALNT12-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT12, Length 2,735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT12-201ENST00000375011 BCANQ96GW7 911 aa32.56■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 ABCC5O15440 1437 aa32.55■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 AKNAQ7Z591 1439 aa32.54■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.54■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 CCER2I3L3R5 266 aa32.52■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
GALNT12-201ENST00000375011 CEP170Q5SW79 1584 aa32.49■■■□□ 2.79
GALNT12-201ENST00000375011 WASHC2AQ641Q2 1341 aa32.49■■■□□ 2.79
GALNT12-201ENST00000375011 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
GALNT12-201ENST00000375011 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
GALNT12-201ENST00000375011 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
GALNT12-201ENST00000375011 FKBP8Q14318 412 aa32.45■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 JPH4Q96JJ6 628 aa32.42■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP32.42■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 ROCK1Q13464 1354 aa32.4■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 SYNJ2O15056 1496 aa32.4■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.4■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa32.39■■■□□ 2.78
GALNT12-201ENST00000375011 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.77
GALNT12-201ENST00000375011 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
GALNT12-201ENST00000375011 KIF14Q15058 1648 aa32.38■■■□□ 2.77
GALNT12-201ENST00000375011 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.35■■■□□ 2.77
GALNT12-201ENST00000375011 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.32■■■□□ 2.76
GALNT12-201ENST00000375011 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
GALNT12-201ENST00000375011 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.27■■■□□ 2.76
GALNT12-201ENST00000375011 NCOA1Q15788 1441 aa32.25■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 CCDC184Q52MB2 194 aa32.25■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.23■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 NUP160Q12769 1436 aa32.22■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 PZPP20742 1482 aa32.22■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa32.21■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 PLEKHD1A6NEE1 506 aa32.2■■■□□ 2.75
GALNT12-201ENST00000375011 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.19■■■□□ 2.74
GALNT12-201ENST00000375011 NEFLP07196 543 aa32.17■■■□□ 2.74
GALNT12-201ENST00000375011 PKD2Q13563 968 aa32.17■■■□□ 2.74
GALNT12-201ENST00000375011 CCDC7Q96M83 1385 aa32.17■■■□□ 2.74
GALNT12-201ENST00000375011 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
GALNT12-201ENST00000375011 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.14■■■□□ 2.74
GALNT12-201ENST00000375011 ATP10BO94823 1461 aa32.12■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.12■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.11■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.1■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 KIF7Q2M1P5 1343 aa32.09■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 POLR3GLQ9BT43 218 aa32.09■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa32.08■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
GALNT12-201ENST00000375011 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.07■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa32.07■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 ABCA8O94911 1581 aa32.06■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 FAM9BQ8IZU0 186 aa32.06■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.04■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa32.04■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 ADGRL2O95490 1459 aa32.03■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 NUP155O75694 1391 aa32.02■■■□□ 2.72
GALNT12-201ENST00000375011 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.01■■■□□ 2.71
GALNT12-201ENST00000375011 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.99■■■□□ 2.71
GALNT12-201ENST00000375011 MRS2Q9HD23 443 aa31.99■■■□□ 2.71
GALNT12-201ENST00000375011 TSPY4P0CV99 314 aa31.98■■■□□ 2.71
GALNT12-201ENST00000375011 TSPY10P0CW01 314 aa31.98■■■□□ 2.71
GALNT12-201ENST00000375011 PTPRGP23470 1445 aa31.95■■■□□ 2.71
GALNT12-201ENST00000375011 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa31.94■■■□□ 2.7
GALNT12-201ENST00000375011 USP47Q96K76 1375 aa31.91■■■□□ 2.7
GALNT12-201ENST00000375011 MBD5Q9P267 1494 aa31.9■■■□□ 2.7
GALNT12-201ENST00000375011 KIF15Q9NS87 1388 aa31.88■■■□□ 2.69
GALNT12-201ENST00000375011 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.86■■■□□ 2.69
GALNT12-201ENST00000375011 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa31.83■■■□□ 2.69
GALNT12-201ENST00000375011 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.8■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 DCAF11Q8TEB1 546 aa31.8■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 CARD11Q9BXL7 1154 aa31.79■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.77■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 CHD1O14646 1710 aa31.76■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.76■■■□□ 2.68
GALNT12-201ENST00000375011 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.75■■■□□ 2.671e-7■■■■□ 26.1
GALNT12-201ENST00000375011 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
GALNT12-201ENST00000375011 KDM5CP41229 1560 aa31.73■■■□□ 2.67
GALNT12-201ENST00000375011 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa31.7■■■□□ 2.67
GALNT12-201ENST00000375011 RGL3Q3MIN7 710 aa31.7■■■□□ 2.67
GALNT12-201ENST00000375011 ANP32EQ9BTT0 268 aa31.7■■■□□ 2.67
GALNT12-201ENST00000375011 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.7■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.69■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.67■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.67■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 PREX2Q70Z35 1606 aa31.66■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.65■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.65■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.64■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 RALGAPBQ86X10 1494 aa31.64■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.64■■■□□ 2.66
GALNT12-201ENST00000375011 KDM5DQ9BY66 1539 aa31.64■■■□□ 2.65
GALNT12-201ENST00000375011 FAM135AQ9P2D6 1515 aa31.63■■■□□ 2.65
GALNT12-201ENST00000375011 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.65
GALNT12-201ENST00000375011 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms