RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370206.8

CNN3-201, Transcript of calponin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNN3, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-201ENST00000370206 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CNN3-201ENST00000370206 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.28■■■□□ 2.6
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CNN3-201ENST00000370206 FBLN2P98095 1184 aa31.26■■■□□ 2.6
CNN3-201ENST00000370206 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.26■■■□□ 2.6
CNN3-201ENST00000370206 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.25■■■□□ 2.59
CNN3-201ENST00000370206 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
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CNN3-201ENST00000370206 KCNH8Q96L42 1107 aa31.23■■■□□ 2.59
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CNN3-201ENST00000370206 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.11■■■□□ 2.57
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CNN3-201ENST00000370206 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.09■■■□□ 2.57
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CNN3-201ENST00000370206 TEX14Q8IWB6 1497 aa31■■■□□ 2.55
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CNN3-201ENST00000370206 WASHC2AQ641Q2 1341 aa30.92■■■□□ 2.54
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CNN3-201ENST00000370206 C9orf84Q5VXU9 1444 aa30.83■■■□□ 2.53
CNN3-201ENST00000370206 CHD1O14646 1710 aa30.83■■■□□ 2.53
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CNN3-201ENST00000370206 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.78■■■□□ 2.52
CNN3-201ENST00000370206 MBD5Q9P267 1494 aa30.78■■■□□ 2.52
CNN3-201ENST00000370206 SHROOM2Q13796 1616 aa30.77■■■□□ 2.52
CNN3-201ENST00000370206 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.76■■■□□ 2.51
CNN3-201ENST00000370206 CCDC7Q96M83 1385 aa30.76■■■□□ 2.51
CNN3-201ENST00000370206 PKD2Q13563 968 aa30.73■■■□□ 2.51
CNN3-201ENST00000370206 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.73■■■□□ 2.51
CNN3-201ENST00000370206 PREX2Q70Z35 1606 aa30.72■■■□□ 2.51
CNN3-201ENST00000370206 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
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CNN3-201ENST00000370206 TSPY10P0CW01 314 aa30.71■■■□□ 2.51
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CNN3-201ENST00000370206 NUP155O75694 1391 aa30.67■■■□□ 2.5
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CNN3-201ENST00000370206 CCDC141Q6ZP82 1450 aa30.66■■■□□ 2.5
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CNN3-201ENST00000370206 ABCC2Q92887 1545 aa30.58■■■□□ 2.49
CNN3-201ENST00000370206 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.57■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.57■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa30.57■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.55■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.55■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.54■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 FKBP8Q14318 412 aa30.54■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
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CNN3-201ENST00000370206 USP47Q96K76 1375 aa30.52■■■□□ 2.48
CNN3-201ENST00000370206 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.5■■■□□ 2.47
CNN3-201ENST00000370206 KDM5CP41229 1560 aa30.5■■■□□ 2.47
CNN3-201ENST00000370206 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.49■■■□□ 2.47
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CNN3-201ENST00000370206 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.48■■■□□ 2.47
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CNN3-201ENST00000370206 BCANQ96GW7 911 aa30.39■■■□□ 2.46
CNN3-201ENST00000370206 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.38■■■□□ 2.45
CNN3-201ENST00000370206 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CNN3-201ENST00000370206 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CNN3-201ENST00000370206 MRS2Q9HD23 443 aa30.35■■■□□ 2.45
CNN3-201ENST00000370206 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.32■■■□□ 2.44
CNN3-201ENST00000370206 PLCH2O75038 1416 aa30.32■■■□□ 2.44
CNN3-201ENST00000370206 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.31■■■□□ 2.44
CNN3-201ENST00000370206 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa30.3■■■□□ 2.44
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