RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369875.3

CNNM2-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM2, Length 2,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-201ENST00000369875 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
CNNM2-201ENST00000369875 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.26■■■■□ 3.39
CNNM2-201ENST00000369875 ABCC5O15440 1437 aa36.26■■■■□ 3.39
CNNM2-201ENST00000369875 KCNH8Q96L42 1107 aa36.22■■■■□ 3.39
CNNM2-201ENST00000369875 MAPKBP1O60336 1514 aa36.19■■■■□ 3.38
CNNM2-201ENST00000369875 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.18■■■■□ 3.38
CNNM2-201ENST00000369875 AKNAQ7Z591 1439 aa36.17■■■■□ 3.38
CNNM2-201ENST00000369875 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.16■■■■□ 3.38
CNNM2-201ENST00000369875 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
CNNM2-201ENST00000369875 PREX2Q70Z35 1606 aa36.12■■■■□ 3.37
CNNM2-201ENST00000369875 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.11■■■■□ 3.37
CNNM2-201ENST00000369875 ROCK1Q13464 1354 aa36.1■■■■□ 3.37
CNNM2-201ENST00000369875 KDM6BO15054 1643 aa36.07■■■■□ 3.37
CNNM2-201ENST00000369875 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.05■■■■□ 3.36
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.04■■■■□ 3.36
CNNM2-201ENST00000369875 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.02■■■■□ 3.36
CNNM2-201ENST00000369875 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.02■■■■□ 3.36
CNNM2-201ENST00000369875 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.02■■■■□ 3.36
CNNM2-201ENST00000369875 ADGBQ8N7X0 1667 aa36■■■■□ 3.35
CNNM2-201ENST00000369875 TRIM52Q96A61 297 aa35.99■■■■□ 3.35
CNNM2-201ENST00000369875 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.96■■■■□ 3.35
CNNM2-201ENST00000369875 NCOA1Q15788 1441 aa35.96■■■■□ 3.35
CNNM2-201ENST00000369875 SIN3AQ96ST3 1273 aa35.95■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 NEUROD1Q13562 356 aa35.93■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 ADGRL2O95490 1459 aa35.93■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 TSPY4P0CV99 314 aa35.92■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 TSPY10P0CW01 314 aa35.92■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 MBD5Q9P267 1494 aa35.92■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.92■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 C9orf84Q5VXU9 1444 aa35.92■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGEF5Q12774 1597 aa35.91■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.9■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.9■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 PLCH2O75038 1416 aa35.9■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.89■■■■□ 3.34
CNNM2-201ENST00000369875 ASXL2Q76L83 1435 aa35.88■■■■□ 3.33
CNNM2-201ENST00000369875 CCDC141Q6ZP82 1450 aa35.87■■■■□ 3.33
CNNM2-201ENST00000369875 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.82■■■■□ 3.32
CNNM2-201ENST00000369875 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.81■■■■□ 3.32
CNNM2-201ENST00000369875 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.79■■■■□ 3.32
CNNM2-201ENST00000369875 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.78■■■■□ 3.32
CNNM2-201ENST00000369875 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.76■■■■□ 3.32
CNNM2-201ENST00000369875 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.76■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.73■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.73■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 KIF15Q9NS87 1388 aa35.72■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.71■■■■□ 3.31
CNNM2-201ENST00000369875 ABCC1P33527 1531 aa35.69■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.69■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.68■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.68■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.68■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 FOXD1Q16676 465 aa35.67■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.64■■■■□ 3.3
CNNM2-201ENST00000369875 FANCAO15360 1455 aa35.63■■■■□ 3.29
CNNM2-201ENST00000369875 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.62■■■■□ 3.29
CNNM2-201ENST00000369875 TONSLQ96HA7 1378 aa35.61■■■■□ 3.29
CNNM2-201ENST00000369875 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.6■■■■□ 3.29
CNNM2-201ENST00000369875 PZPP20742 1482 aa35.59■■■■□ 3.29
CNNM2-201ENST00000369875 AFAP1Q8N556 730 aa35.53■■■■□ 3.28
CNNM2-201ENST00000369875 NUP155O75694 1391 aa35.53■■■■□ 3.28
CNNM2-201ENST00000369875 PLXNC1O60486 1568 aa35.52■■■■□ 3.28
CNNM2-201ENST00000369875 ADGRL1O94910 1474 aa35.5■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 CD109Q6YHK3 1445 aa35.48■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.47■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.46■■■■□ 3.27
CNNM2-201ENST00000369875 PKD2Q13563 968 aa35.44■■■■□ 3.26
CNNM2-201ENST00000369875 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.42■■■■□ 3.26
CNNM2-201ENST00000369875 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.4■■■■□ 3.26
CNNM2-201ENST00000369875 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.39■■■■□ 3.26
CNNM2-201ENST00000369875 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.38■■■■□ 3.25
CNNM2-201ENST00000369875 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.36■■■■□ 3.25
CNNM2-201ENST00000369875 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.35■■■■□ 3.25
CNNM2-201ENST00000369875 ERBINQ96RT1 1412 aa35.33■■■■□ 3.25
CNNM2-201ENST00000369875 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CNNM2-201ENST00000369875 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.32■■■■□ 3.24
CNNM2-201ENST00000369875 ATP7AQ04656 1500 aa35.31■■■■□ 3.24
CNNM2-201ENST00000369875 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.31■■■■□ 3.24
CNNM2-201ENST00000369875 UNC13BO14795 1591 aa35.31■■■■□ 3.24
CNNM2-201ENST00000369875 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
CNNM2-201ENST00000369875 L3MBTL2Q969R5 705 aa35.26■■■■□ 3.23
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.24■■■■□ 3.23
CNNM2-201ENST00000369875 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.19■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.18■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.18■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.17■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.17■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.16■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 NEO1Q92859 1461 aa35.16■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 GLI2P10070 1586 aa35.15■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.15■■■■□ 3.22
CNNM2-201ENST00000369875 DIP2BQ9P265 1576 aa35.12■■■■□ 3.21
CNNM2-201ENST00000369875 KDM5CP41229 1560 aa35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7 ms