RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
TTC13-201ENST00000366661 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.12■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.12■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 MAP3K1Q13233 1512 aa21.11■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 HECW1Q76N89 1606 aa21.1■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.1■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 PTPRGP23470 1445 aa21.1■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 ABCA8O94911 1581 aa21.08■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.08■□□□□ 0.97
TTC13-201ENST00000366661 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.08■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.07■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.04■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.03■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 ARHGEF11O15085 1522 aa21.03■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.03■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.02■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 NCOA2Q15596 1464 aa21.02■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.02■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.02■□□□□ 0.96
TTC13-201ENST00000366661 NEFMP07197 916 aa21.02■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.01■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 UACAQ9BZF9 1416 aa21■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 ABCC2Q92887 1545 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.99■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.97■□□□□ 0.95
TTC13-201ENST00000366661 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.95■□□□□ 0.94
TTC13-201ENST00000366661 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
TTC13-201ENST00000366661 PTPRKQ15262 1439 aa20.91■□□□□ 0.94
TTC13-201ENST00000366661 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.91■□□□□ 0.94
TTC13-201ENST00000366661 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.89■□□□□ 0.94
TTC13-201ENST00000366661 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.88■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.88■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 ATP10BO94823 1461 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.86■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 CCER2I3L3R5 266 aa20.85■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 CCDC184Q52MB2 194 aa20.84■□□□□ 0.93
TTC13-201ENST00000366661 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.83■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.83■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 FOXD1Q16676 465 aa20.82■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 ARXQ96QS3 562 aa20.81■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
TTC13-201ENST00000366661 SLC4A3P48751 1232 aa20.76■□□□□ 0.91
TTC13-201ENST00000366661 MRS2Q9HD23 443 aa20.74■□□□□ 0.91
TTC13-201ENST00000366661 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.73■□□□□ 0.91
TTC13-201ENST00000366661 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.72■□□□□ 0.91
TTC13-201ENST00000366661 KIF14Q15058 1648 aa20.7■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.69■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 VSIG10Q8N0Z9 540 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 NAIPQ13075 1403 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 MAPKBP1O60336 1514 aa20.69■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.68■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.68■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.66■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 SKAP1Q86WV1 359 aa20.65■□□□□ 0.9
TTC13-201ENST00000366661 HFM1A2PYH4 1435 aa20.64■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 ASXL2Q76L83 1435 aa20.62■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.62■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.61■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 PLEKHG5O94827 1062 aa20.61■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 ABCC5O15440 1437 aa20.6■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 MIA2Q96PC5 1412 aa20.6■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.59■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 TSPY4P0CV99 314 aa20.58■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 TSPY10P0CW01 314 aa20.58■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 TONSLQ96HA7 1378 aa20.58■□□□□ 0.89
TTC13-201ENST00000366661 DAPK1P53355 1430 aa20.58■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.57■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.882e-7■■■■□ 26.2
TTC13-201ENST00000366661 AKNAQ7Z591 1439 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.55■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 GSE1Q14687 1217 aa20.54■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.54■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 KDM6BO15054 1643 aa20.54■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 PREX2Q70Z35 1606 aa20.53■□□□□ 0.88
TTC13-201ENST00000366661 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms